Protein–RNA interactions for Protein: Q07954

LRP1, Prolow-density lipoprotein receptor-related protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 4,544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRP1Q07954 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC9.91□□□□□ -0.82
LRP1Q07954 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.91□□□□□ -0.82
LRP1Q07954 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
LRP1Q07954 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
LRP1Q07954 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
LRP1Q07954 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
LRP1Q07954 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
LRP1Q07954 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
LRP1Q07954 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC9.91□□□□□ -0.82
LRP1Q07954 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
LRP1Q07954 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
LRP1Q07954 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
LRP1Q07954 UBE2T-201ENST00000367274 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
LRP1Q07954 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
LRP1Q07954 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC9.91□□□□□ -0.82
LRP1Q07954 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
LRP1Q07954 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC9.91□□□□□ -0.82
LRP1Q07954 AC106772.2-201ENST00000515085 442 ntTSL 3 BASIC9.91□□□□□ -0.82
LRP1Q07954 AP002748.3-205ENST00000525142 567 ntTSL 3 BASIC9.91□□□□□ -0.82
LRP1Q07954 AP002748.3-203ENST00000533502 581 ntTSL 3 BASIC9.91□□□□□ -0.82
LRP1Q07954 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC9.91□□□□□ -0.82
LRP1Q07954 CMTM3-212ENST00000566121 572 ntTSL 3 BASIC9.91□□□□□ -0.82
LRP1Q07954 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC9.91□□□□□ -0.82
LRP1Q07954 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
LRP1Q07954 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
LRP1Q07954 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
LRP1Q07954 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
LRP1Q07954 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
LRP1Q07954 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
LRP1Q07954 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
LRP1Q07954 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.91□□□□□ -0.82
LRP1Q07954 MIR1908-201ENST00000410394 80 ntBASIC9.91□□□□□ -0.82
LRP1Q07954 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
LRP1Q07954 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
LRP1Q07954 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
LRP1Q07954 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC9.91□□□□□ -0.82
LRP1Q07954 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC9.91□□□□□ -0.82
LRP1Q07954 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
LRP1Q07954 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
LRP1Q07954 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC9.9□□□□□ -0.82
LRP1Q07954 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
LRP1Q07954 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
LRP1Q07954 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
LRP1Q07954 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
LRP1Q07954 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.9□□□□□ -0.82
LRP1Q07954 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
LRP1Q07954 TMEM170A-203ENST00000566980 547 ntTSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
LRP1Q07954 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
LRP1Q07954 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC9.9□□□□□ -0.82
LRP1Q07954 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
LRP1Q07954 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
LRP1Q07954 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
LRP1Q07954 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
LRP1Q07954 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
LRP1Q07954 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC9.9□□□□□ -0.82
LRP1Q07954 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
LRP1Q07954 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
LRP1Q07954 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
LRP1Q07954 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
LRP1Q07954 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
LRP1Q07954 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
LRP1Q07954 AC010336.6-201ENST00000595107 528 ntTSL 4 BASIC9.9□□□□□ -0.82
LRP1Q07954 FLT3LG-205ENST00000596435 1034 ntTSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
LRP1Q07954 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
LRP1Q07954 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.9□□□□□ -0.82
LRP1Q07954 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
LRP1Q07954 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
LRP1Q07954 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
LRP1Q07954 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
LRP1Q07954 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
LRP1Q07954 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
LRP1Q07954 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
LRP1Q07954 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
LRP1Q07954 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
LRP1Q07954 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
LRP1Q07954 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
LRP1Q07954 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
LRP1Q07954 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
LRP1Q07954 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.9□□□□□ -0.82
LRP1Q07954 IGLV2-23-201ENST00000390306 502 ntAPPRIS P1 BASIC9.9□□□□□ -0.82
LRP1Q07954 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
LRP1Q07954 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
LRP1Q07954 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
LRP1Q07954 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
LRP1Q07954 SYNE2-228ENST00000639659 1290 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
LRP1Q07954 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
LRP1Q07954 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
LRP1Q07954 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
LRP1Q07954 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
LRP1Q07954 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
LRP1Q07954 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC9.9□□□□□ -0.83
LRP1Q07954 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
LRP1Q07954 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
LRP1Q07954 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
LRP1Q07954 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
LRP1Q07954 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.83
LRP1Q07954 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC9.9□□□□□ -0.83
LRP1Q07954 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
LRP1Q07954 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.83
LRP1Q07954 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC9.9□□□□□ -0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms