Protein–RNA interactions for Protein: Q07864

POLE, DNA polymerase epsilon catalytic subunit A, humanhuman

Predictions only

Length 2,286 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLEQ07864 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
POLEQ07864 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
POLEQ07864 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
POLEQ07864 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
POLEQ07864 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
POLEQ07864 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
POLEQ07864 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
POLEQ07864 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
POLEQ07864 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
POLEQ07864 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
POLEQ07864 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
POLEQ07864 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
POLEQ07864 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
POLEQ07864 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
POLEQ07864 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
POLEQ07864 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC15.06■□□□□ 0
POLEQ07864 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
POLEQ07864 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
POLEQ07864 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
POLEQ07864 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
POLEQ07864 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
POLEQ07864 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
POLEQ07864 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
POLEQ07864 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
POLEQ07864 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
POLEQ07864 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
POLEQ07864 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
POLEQ07864 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
POLEQ07864 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
POLEQ07864 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
POLEQ07864 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
POLEQ07864 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
POLEQ07864 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
POLEQ07864 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
POLEQ07864 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
POLEQ07864 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
POLEQ07864 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
POLEQ07864 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
POLEQ07864 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ 0
POLEQ07864 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
POLEQ07864 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
POLEQ07864 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
POLEQ07864 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
POLEQ07864 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ 0
POLEQ07864 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC15.05■□□□□ 0
POLEQ07864 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ 0
POLEQ07864 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ 0
POLEQ07864 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ 0
POLEQ07864 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
POLEQ07864 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
POLEQ07864 SNHG15-207ENST00000582727 1039 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
POLEQ07864 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC15.05■□□□□ 0
POLEQ07864 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ 0
POLEQ07864 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
POLEQ07864 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
POLEQ07864 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
POLEQ07864 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
POLEQ07864 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
POLEQ07864 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
POLEQ07864 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
POLEQ07864 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
POLEQ07864 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
POLEQ07864 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
POLEQ07864 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
POLEQ07864 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
POLEQ07864 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
POLEQ07864 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
POLEQ07864 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
POLEQ07864 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
POLEQ07864 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
POLEQ07864 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
POLEQ07864 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC15.05■□□□□ -0
POLEQ07864 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
POLEQ07864 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
POLEQ07864 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
POLEQ07864 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
POLEQ07864 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC15.05■□□□□ -0
POLEQ07864 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
POLEQ07864 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
POLEQ07864 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
POLEQ07864 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
POLEQ07864 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
POLEQ07864 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
POLEQ07864 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
POLEQ07864 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
POLEQ07864 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
POLEQ07864 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
POLEQ07864 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
POLEQ07864 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
POLEQ07864 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
POLEQ07864 TEX12-201ENST00000280358 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
POLEQ07864 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC15.04■□□□□ -0
POLEQ07864 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
POLEQ07864 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
POLEQ07864 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
POLEQ07864 AL132711.1-201ENST00000557546 722 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
POLEQ07864 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
POLEQ07864 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
POLEQ07864 IGHV3-72-202ENST00000621503 303 ntBASIC15.04■□□□□ -0
POLEQ07864 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 100.3 ms