Protein–RNA interactions for Protein: Q07837

SLC3A1, Neutral and basic amino acid transport protein rBAT, humanhuman

Predictions only

Length 685 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC3A1Q07837 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC3A1Q07837 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC3A1Q07837 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC3A1Q07837 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC3A1Q07837 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC3A1Q07837 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC3A1Q07837 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC3A1Q07837 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC3A1Q07837 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC3A1Q07837 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC3A1Q07837 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC3A1Q07837 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC3A1Q07837 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC3A1Q07837 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC3A1Q07837 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC3A1Q07837 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC3A1Q07837 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC3A1Q07837 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC3A1Q07837 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC3A1Q07837 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC3A1Q07837 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC3A1Q07837 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC3A1Q07837 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC3A1Q07837 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC3A1Q07837 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC3A1Q07837 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC3A1Q07837 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC3A1Q07837 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC3A1Q07837 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC3A1Q07837 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC3A1Q07837 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC3A1Q07837 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC3A1Q07837 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC3A1Q07837 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC3A1Q07837 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC3A1Q07837 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC3A1Q07837 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC3A1Q07837 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC3A1Q07837 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC3A1Q07837 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC3A1Q07837 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC3A1Q07837 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC3A1Q07837 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC3A1Q07837 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC3A1Q07837 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC3A1Q07837 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC3A1Q07837 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC3A1Q07837 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC3A1Q07837 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC3A1Q07837 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC3A1Q07837 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC3A1Q07837 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC3A1Q07837 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC3A1Q07837 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC3A1Q07837 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC3A1Q07837 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC3A1Q07837 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC3A1Q07837 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC3A1Q07837 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC3A1Q07837 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC3A1Q07837 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC3A1Q07837 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC3A1Q07837 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC3A1Q07837 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC3A1Q07837 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC3A1Q07837 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC3A1Q07837 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC3A1Q07837 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC3A1Q07837 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC3A1Q07837 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC3A1Q07837 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC3A1Q07837 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC3A1Q07837 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC3A1Q07837 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC3A1Q07837 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC3A1Q07837 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC3A1Q07837 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC3A1Q07837 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC3A1Q07837 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC3A1Q07837 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC3A1Q07837 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC3A1Q07837 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC3A1Q07837 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC3A1Q07837 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC3A1Q07837 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC3A1Q07837 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC3A1Q07837 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC3A1Q07837 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC3A1Q07837 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC3A1Q07837 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC3A1Q07837 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC3A1Q07837 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC3A1Q07837 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC3A1Q07837 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC3A1Q07837 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC3A1Q07837 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC3A1Q07837 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC3A1Q07837 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC3A1Q07837 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC3A1Q07837 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.4 ms