Protein–RNA interactions for Protein: Q06643

LTB, Lymphotoxin-beta, humanhuman

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBQ06643 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LTBQ06643 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LTBQ06643 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LTBQ06643 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LTBQ06643 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LTBQ06643 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LTBQ06643 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
LTBQ06643 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LTBQ06643 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LTBQ06643 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LTBQ06643 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
LTBQ06643 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LTBQ06643 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LTBQ06643 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LTBQ06643 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
LTBQ06643 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
LTBQ06643 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LTBQ06643 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LTBQ06643 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LTBQ06643 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LTBQ06643 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LTBQ06643 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LTBQ06643 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LTBQ06643 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LTBQ06643 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LTBQ06643 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LTBQ06643 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LTBQ06643 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LTBQ06643 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LTBQ06643 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LTBQ06643 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LTBQ06643 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LTBQ06643 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LTBQ06643 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LTBQ06643 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LTBQ06643 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LTBQ06643 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
LTBQ06643 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LTBQ06643 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LTBQ06643 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LTBQ06643 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LTBQ06643 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LTBQ06643 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
LTBQ06643 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LTBQ06643 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LTBQ06643 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LTBQ06643 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LTBQ06643 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LTBQ06643 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
LTBQ06643 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
LTBQ06643 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LTBQ06643 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LTBQ06643 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LTBQ06643 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LTBQ06643 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LTBQ06643 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LTBQ06643 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LTBQ06643 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LTBQ06643 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LTBQ06643 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LTBQ06643 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LTBQ06643 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LTBQ06643 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LTBQ06643 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LTBQ06643 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LTBQ06643 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LTBQ06643 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LTBQ06643 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
LTBQ06643 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LTBQ06643 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LTBQ06643 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LTBQ06643 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LTBQ06643 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LTBQ06643 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LTBQ06643 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LTBQ06643 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LTBQ06643 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LTBQ06643 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LTBQ06643 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LTBQ06643 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LTBQ06643 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LTBQ06643 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
LTBQ06643 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LTBQ06643 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
LTBQ06643 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LTBQ06643 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LTBQ06643 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LTBQ06643 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LTBQ06643 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LTBQ06643 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LTBQ06643 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LTBQ06643 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LTBQ06643 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LTBQ06643 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LTBQ06643 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LTBQ06643 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LTBQ06643 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LTBQ06643 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LTBQ06643 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LTBQ06643 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms