Protein–RNA interactions for Protein: Q02487

DSC2, Desmocollin-2, humanhuman

Predictions only

Length 901 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSC2Q02487 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
DSC2Q02487 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
DSC2Q02487 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
DSC2Q02487 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
DSC2Q02487 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC17.24■□□□□ 0.35
DSC2Q02487 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
DSC2Q02487 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
DSC2Q02487 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
DSC2Q02487 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
DSC2Q02487 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
DSC2Q02487 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
DSC2Q02487 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
DSC2Q02487 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
DSC2Q02487 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
DSC2Q02487 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
DSC2Q02487 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
DSC2Q02487 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
DSC2Q02487 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
DSC2Q02487 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
DSC2Q02487 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
DSC2Q02487 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
DSC2Q02487 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
DSC2Q02487 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
DSC2Q02487 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
DSC2Q02487 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
DSC2Q02487 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
DSC2Q02487 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
DSC2Q02487 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
DSC2Q02487 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
DSC2Q02487 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
DSC2Q02487 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
DSC2Q02487 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
DSC2Q02487 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
DSC2Q02487 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
DSC2Q02487 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
DSC2Q02487 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
DSC2Q02487 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
DSC2Q02487 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
DSC2Q02487 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
DSC2Q02487 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
DSC2Q02487 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
DSC2Q02487 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
DSC2Q02487 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
DSC2Q02487 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
DSC2Q02487 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
DSC2Q02487 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
DSC2Q02487 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
DSC2Q02487 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
DSC2Q02487 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
DSC2Q02487 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
DSC2Q02487 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
DSC2Q02487 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
DSC2Q02487 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
DSC2Q02487 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
DSC2Q02487 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
DSC2Q02487 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
DSC2Q02487 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
DSC2Q02487 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
DSC2Q02487 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
DSC2Q02487 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
DSC2Q02487 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
DSC2Q02487 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
DSC2Q02487 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
DSC2Q02487 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
DSC2Q02487 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
DSC2Q02487 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
DSC2Q02487 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
DSC2Q02487 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
DSC2Q02487 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
DSC2Q02487 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
DSC2Q02487 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
DSC2Q02487 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
DSC2Q02487 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
DSC2Q02487 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
DSC2Q02487 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
DSC2Q02487 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
DSC2Q02487 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
DSC2Q02487 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
DSC2Q02487 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
DSC2Q02487 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
DSC2Q02487 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
DSC2Q02487 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
DSC2Q02487 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
DSC2Q02487 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
DSC2Q02487 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
DSC2Q02487 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
DSC2Q02487 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
DSC2Q02487 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
DSC2Q02487 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
DSC2Q02487 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
DSC2Q02487 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
DSC2Q02487 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
DSC2Q02487 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
DSC2Q02487 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
DSC2Q02487 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
DSC2Q02487 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
DSC2Q02487 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
DSC2Q02487 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
DSC2Q02487 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
DSC2Q02487 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms