Protein–RNA interactions for Protein: Q00535

CDK5, Cyclin-dependent-like kinase 5, humanhuman

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK5Q00535 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDK5Q00535 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDK5Q00535 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDK5Q00535 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDK5Q00535 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDK5Q00535 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDK5Q00535 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDK5Q00535 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDK5Q00535 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDK5Q00535 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDK5Q00535 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDK5Q00535 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDK5Q00535 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDK5Q00535 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CDK5Q00535 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDK5Q00535 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDK5Q00535 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDK5Q00535 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDK5Q00535 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDK5Q00535 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CDK5Q00535 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDK5Q00535 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDK5Q00535 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDK5Q00535 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDK5Q00535 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDK5Q00535 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDK5Q00535 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDK5Q00535 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDK5Q00535 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDK5Q00535 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDK5Q00535 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDK5Q00535 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDK5Q00535 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDK5Q00535 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDK5Q00535 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDK5Q00535 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDK5Q00535 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CDK5Q00535 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CDK5Q00535 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDK5Q00535 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CDK5Q00535 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDK5Q00535 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDK5Q00535 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDK5Q00535 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDK5Q00535 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDK5Q00535 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDK5Q00535 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDK5Q00535 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDK5Q00535 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDK5Q00535 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDK5Q00535 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDK5Q00535 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDK5Q00535 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDK5Q00535 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDK5Q00535 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDK5Q00535 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDK5Q00535 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDK5Q00535 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDK5Q00535 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDK5Q00535 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDK5Q00535 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDK5Q00535 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDK5Q00535 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDK5Q00535 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDK5Q00535 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDK5Q00535 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDK5Q00535 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDK5Q00535 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDK5Q00535 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDK5Q00535 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDK5Q00535 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CDK5Q00535 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDK5Q00535 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CDK5Q00535 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDK5Q00535 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDK5Q00535 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDK5Q00535 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDK5Q00535 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDK5Q00535 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDK5Q00535 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDK5Q00535 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDK5Q00535 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDK5Q00535 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDK5Q00535 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDK5Q00535 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDK5Q00535 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDK5Q00535 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDK5Q00535 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDK5Q00535 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDK5Q00535 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDK5Q00535 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDK5Q00535 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDK5Q00535 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDK5Q00535 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDK5Q00535 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDK5Q00535 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDK5Q00535 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDK5Q00535 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDK5Q00535 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDK5Q00535 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms