Protein–RNA interactions for Protein: P83105

HTRA4, Serine protease HTRA4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTRA4P83105 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HTRA4P83105 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
HTRA4P83105 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HTRA4P83105 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HTRA4P83105 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HTRA4P83105 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HTRA4P83105 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HTRA4P83105 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HTRA4P83105 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
HTRA4P83105 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HTRA4P83105 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HTRA4P83105 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HTRA4P83105 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HTRA4P83105 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
HTRA4P83105 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HTRA4P83105 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HTRA4P83105 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HTRA4P83105 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HTRA4P83105 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HTRA4P83105 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HTRA4P83105 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HTRA4P83105 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HTRA4P83105 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HTRA4P83105 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HTRA4P83105 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HTRA4P83105 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HTRA4P83105 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HTRA4P83105 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HTRA4P83105 IFT20-203ENST00000395418 825 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HTRA4P83105 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HTRA4P83105 AL354710.2-201ENST00000468244 550 ntTSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HTRA4P83105 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
HTRA4P83105 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HTRA4P83105 CHRNA5-203ENST00000559554 1051 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HTRA4P83105 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HTRA4P83105 IFT20-216ENST00000588477 774 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HTRA4P83105 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HTRA4P83105 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
HTRA4P83105 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HTRA4P83105 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HTRA4P83105 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HTRA4P83105 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HTRA4P83105 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HTRA4P83105 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HTRA4P83105 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HTRA4P83105 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HTRA4P83105 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HTRA4P83105 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HTRA4P83105 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HTRA4P83105 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HTRA4P83105 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HTRA4P83105 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HTRA4P83105 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HTRA4P83105 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HTRA4P83105 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HTRA4P83105 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HTRA4P83105 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HTRA4P83105 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HTRA4P83105 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HTRA4P83105 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HTRA4P83105 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HTRA4P83105 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HTRA4P83105 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HTRA4P83105 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
HTRA4P83105 H2AFV-207ENST00000446531 1041 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HTRA4P83105 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HTRA4P83105 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HTRA4P83105 ZFPL1-207ENST00000526791 384 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HTRA4P83105 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
HTRA4P83105 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HTRA4P83105 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HTRA4P83105 IGHV3-72-202ENST00000621503 303 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
HTRA4P83105 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HTRA4P83105 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HTRA4P83105 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
HTRA4P83105 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HTRA4P83105 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HTRA4P83105 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HTRA4P83105 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HTRA4P83105 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HTRA4P83105 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HTRA4P83105 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HTRA4P83105 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HTRA4P83105 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HTRA4P83105 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HTRA4P83105 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HTRA4P83105 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HTRA4P83105 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HTRA4P83105 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HTRA4P83105 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HTRA4P83105 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HTRA4P83105 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HTRA4P83105 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HTRA4P83105 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HTRA4P83105 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HTRA4P83105 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HTRA4P83105 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HTRA4P83105 NAA10-201ENST00000370009 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HTRA4P83105 NAA10-203ENST00000370015 1002 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HTRA4P83105 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.7 ms