Protein–RNA interactions for Protein: P68133

ACTA1, Actin, alpha skeletal muscle, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTA1P68133 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ACTA1P68133 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ACTA1P68133 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
ACTA1P68133 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
ACTA1P68133 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
ACTA1P68133 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ACTA1P68133 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ACTA1P68133 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ACTA1P68133 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ACTA1P68133 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ACTA1P68133 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ACTA1P68133 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ACTA1P68133 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
ACTA1P68133 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
ACTA1P68133 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ACTA1P68133 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ACTA1P68133 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ACTA1P68133 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ACTA1P68133 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ACTA1P68133 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ACTA1P68133 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ACTA1P68133 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ACTA1P68133 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ACTA1P68133 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ACTA1P68133 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ACTA1P68133 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
ACTA1P68133 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
ACTA1P68133 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
ACTA1P68133 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
ACTA1P68133 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ACTA1P68133 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ACTA1P68133 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ACTA1P68133 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ACTA1P68133 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ACTA1P68133 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ACTA1P68133 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ACTA1P68133 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ACTA1P68133 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ACTA1P68133 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ACTA1P68133 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ACTA1P68133 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ACTA1P68133 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ACTA1P68133 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ACTA1P68133 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ACTA1P68133 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ACTA1P68133 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ACTA1P68133 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ACTA1P68133 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ACTA1P68133 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ACTA1P68133 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ACTA1P68133 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ACTA1P68133 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ACTA1P68133 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ACTA1P68133 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ACTA1P68133 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ACTA1P68133 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ACTA1P68133 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
ACTA1P68133 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ACTA1P68133 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
ACTA1P68133 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
ACTA1P68133 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ACTA1P68133 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ACTA1P68133 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ACTA1P68133 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ACTA1P68133 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ACTA1P68133 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ACTA1P68133 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ACTA1P68133 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ACTA1P68133 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ACTA1P68133 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ACTA1P68133 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ACTA1P68133 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ACTA1P68133 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ACTA1P68133 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ACTA1P68133 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ACTA1P68133 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ACTA1P68133 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ACTA1P68133 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ACTA1P68133 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ACTA1P68133 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ACTA1P68133 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ACTA1P68133 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ACTA1P68133 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ACTA1P68133 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ACTA1P68133 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ACTA1P68133 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ACTA1P68133 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ACTA1P68133 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ACTA1P68133 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ACTA1P68133 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
ACTA1P68133 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ACTA1P68133 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
ACTA1P68133 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ACTA1P68133 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ACTA1P68133 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ACTA1P68133 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ACTA1P68133 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ACTA1P68133 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ACTA1P68133 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ACTA1P68133 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.2 ms