Protein–RNA interactions for Protein: P62820

RAB1A, Ras-related protein Rab-1A, humanhuman

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB1AP62820 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RAB1AP62820 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC15□□□□□ -0.01
RAB1AP62820 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RAB1AP62820 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RAB1AP62820 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
RAB1AP62820 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RAB1AP62820 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
RAB1AP62820 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RAB1AP62820 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RAB1AP62820 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
RAB1AP62820 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
RAB1AP62820 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
RAB1AP62820 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
RAB1AP62820 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RAB1AP62820 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
RAB1AP62820 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RAB1AP62820 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
RAB1AP62820 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
RAB1AP62820 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
RAB1AP62820 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RAB1AP62820 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RAB1AP62820 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
RAB1AP62820 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC15□□□□□ -0.01
RAB1AP62820 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RAB1AP62820 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
RAB1AP62820 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
RAB1AP62820 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
RAB1AP62820 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RAB1AP62820 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RAB1AP62820 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RAB1AP62820 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
RAB1AP62820 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
RAB1AP62820 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
RAB1AP62820 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
RAB1AP62820 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
RAB1AP62820 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
RAB1AP62820 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
RAB1AP62820 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
RAB1AP62820 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
RAB1AP62820 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
RAB1AP62820 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
RAB1AP62820 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
RAB1AP62820 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
RAB1AP62820 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
RAB1AP62820 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
RAB1AP62820 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
RAB1AP62820 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
RAB1AP62820 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
RAB1AP62820 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
RAB1AP62820 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
RAB1AP62820 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
RAB1AP62820 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
RAB1AP62820 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
RAB1AP62820 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
RAB1AP62820 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
RAB1AP62820 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
RAB1AP62820 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
RAB1AP62820 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
RAB1AP62820 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
RAB1AP62820 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
RAB1AP62820 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
RAB1AP62820 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC14.99□□□□□ -0.01
RAB1AP62820 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
RAB1AP62820 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
RAB1AP62820 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
RAB1AP62820 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
RAB1AP62820 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
RAB1AP62820 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
RAB1AP62820 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
RAB1AP62820 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
RAB1AP62820 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
RAB1AP62820 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
RAB1AP62820 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
RAB1AP62820 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
RAB1AP62820 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
RAB1AP62820 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
RAB1AP62820 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
RAB1AP62820 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
RAB1AP62820 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
RAB1AP62820 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
RAB1AP62820 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
RAB1AP62820 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
RAB1AP62820 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
RAB1AP62820 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
RAB1AP62820 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
RAB1AP62820 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
RAB1AP62820 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
RAB1AP62820 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
RAB1AP62820 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
RAB1AP62820 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
RAB1AP62820 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
RAB1AP62820 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
RAB1AP62820 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
RAB1AP62820 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
RAB1AP62820 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
RAB1AP62820 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
RAB1AP62820 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
RAB1AP62820 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
RAB1AP62820 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
RAB1AP62820 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms