Protein–RNA interactions for Protein: P62316

SNRPD2, Small nuclear ribonucleoprotein Sm D2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRPD2P62316 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNRPD2P62316 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNRPD2P62316 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNRPD2P62316 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNRPD2P62316 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNRPD2P62316 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNRPD2P62316 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNRPD2P62316 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNRPD2P62316 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNRPD2P62316 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNRPD2P62316 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNRPD2P62316 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNRPD2P62316 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNRPD2P62316 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNRPD2P62316 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNRPD2P62316 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNRPD2P62316 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNRPD2P62316 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNRPD2P62316 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNRPD2P62316 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNRPD2P62316 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNRPD2P62316 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNRPD2P62316 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNRPD2P62316 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNRPD2P62316 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNRPD2P62316 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNRPD2P62316 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNRPD2P62316 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNRPD2P62316 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNRPD2P62316 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SNRPD2P62316 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNRPD2P62316 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNRPD2P62316 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNRPD2P62316 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SNRPD2P62316 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNRPD2P62316 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNRPD2P62316 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNRPD2P62316 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SNRPD2P62316 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNRPD2P62316 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNRPD2P62316 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SNRPD2P62316 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNRPD2P62316 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNRPD2P62316 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNRPD2P62316 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNRPD2P62316 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNRPD2P62316 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNRPD2P62316 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNRPD2P62316 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNRPD2P62316 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNRPD2P62316 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNRPD2P62316 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SNRPD2P62316 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SNRPD2P62316 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SNRPD2P62316 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SNRPD2P62316 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SNRPD2P62316 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SNRPD2P62316 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SNRPD2P62316 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SNRPD2P62316 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SNRPD2P62316 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SNRPD2P62316 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SNRPD2P62316 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SNRPD2P62316 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SNRPD2P62316 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SNRPD2P62316 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SNRPD2P62316 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SNRPD2P62316 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SNRPD2P62316 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SNRPD2P62316 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SNRPD2P62316 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SNRPD2P62316 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SNRPD2P62316 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SNRPD2P62316 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SNRPD2P62316 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SNRPD2P62316 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SNRPD2P62316 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SNRPD2P62316 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SNRPD2P62316 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SNRPD2P62316 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SNRPD2P62316 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SNRPD2P62316 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SNRPD2P62316 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SNRPD2P62316 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SNRPD2P62316 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SNRPD2P62316 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SNRPD2P62316 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SNRPD2P62316 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNRPD2P62316 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNRPD2P62316 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNRPD2P62316 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNRPD2P62316 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNRPD2P62316 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNRPD2P62316 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNRPD2P62316 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNRPD2P62316 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNRPD2P62316 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNRPD2P62316 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNRPD2P62316 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNRPD2P62316 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms