Protein–RNA interactions for Protein: P57773

GJA9, Gap junction alpha-9 protein, humanhuman

Predictions only

Length 515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJA9P57773 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GJA9P57773 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GJA9P57773 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GJA9P57773 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GJA9P57773 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GJA9P57773 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GJA9P57773 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GJA9P57773 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GJA9P57773 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GJA9P57773 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GJA9P57773 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GJA9P57773 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GJA9P57773 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GJA9P57773 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GJA9P57773 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GJA9P57773 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GJA9P57773 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GJA9P57773 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GJA9P57773 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GJA9P57773 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GJA9P57773 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GJA9P57773 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GJA9P57773 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GJA9P57773 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GJA9P57773 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GJA9P57773 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GJA9P57773 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GJA9P57773 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GJA9P57773 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
GJA9P57773 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
GJA9P57773 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
GJA9P57773 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GJA9P57773 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GJA9P57773 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
GJA9P57773 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GJA9P57773 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GJA9P57773 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GJA9P57773 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GJA9P57773 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GJA9P57773 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GJA9P57773 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GJA9P57773 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
GJA9P57773 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GJA9P57773 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GJA9P57773 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GJA9P57773 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
GJA9P57773 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GJA9P57773 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GJA9P57773 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GJA9P57773 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GJA9P57773 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GJA9P57773 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GJA9P57773 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GJA9P57773 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GJA9P57773 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GJA9P57773 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GJA9P57773 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GJA9P57773 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GJA9P57773 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GJA9P57773 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GJA9P57773 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GJA9P57773 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
GJA9P57773 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
GJA9P57773 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GJA9P57773 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GJA9P57773 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GJA9P57773 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GJA9P57773 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GJA9P57773 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GJA9P57773 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GJA9P57773 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GJA9P57773 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
GJA9P57773 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GJA9P57773 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GJA9P57773 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GJA9P57773 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GJA9P57773 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GJA9P57773 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
GJA9P57773 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GJA9P57773 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GJA9P57773 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GJA9P57773 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GJA9P57773 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
GJA9P57773 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GJA9P57773 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GJA9P57773 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
GJA9P57773 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GJA9P57773 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
GJA9P57773 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
GJA9P57773 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
GJA9P57773 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
GJA9P57773 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GJA9P57773 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GJA9P57773 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
GJA9P57773 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GJA9P57773 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GJA9P57773 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
GJA9P57773 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GJA9P57773 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GJA9P57773 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.6 ms