Protein–RNA interactions for Protein: P57740

NUP107, Nuclear pore complex protein Nup107, humanhuman

Predictions only

Length 925 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP107P57740 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NUP107P57740 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NUP107P57740 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NUP107P57740 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NUP107P57740 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NUP107P57740 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NUP107P57740 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NUP107P57740 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NUP107P57740 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NUP107P57740 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NUP107P57740 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NUP107P57740 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NUP107P57740 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NUP107P57740 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NUP107P57740 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NUP107P57740 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NUP107P57740 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
NUP107P57740 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NUP107P57740 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NUP107P57740 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NUP107P57740 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NUP107P57740 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NUP107P57740 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
NUP107P57740 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
NUP107P57740 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
NUP107P57740 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NUP107P57740 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NUP107P57740 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NUP107P57740 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NUP107P57740 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NUP107P57740 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NUP107P57740 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NUP107P57740 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NUP107P57740 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NUP107P57740 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
NUP107P57740 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NUP107P57740 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NUP107P57740 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
NUP107P57740 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
NUP107P57740 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
NUP107P57740 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NUP107P57740 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NUP107P57740 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NUP107P57740 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NUP107P57740 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NUP107P57740 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NUP107P57740 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NUP107P57740 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NUP107P57740 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NUP107P57740 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NUP107P57740 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NUP107P57740 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NUP107P57740 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NUP107P57740 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NUP107P57740 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NUP107P57740 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NUP107P57740 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NUP107P57740 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NUP107P57740 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NUP107P57740 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NUP107P57740 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NUP107P57740 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NUP107P57740 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NUP107P57740 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NUP107P57740 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NUP107P57740 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NUP107P57740 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NUP107P57740 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NUP107P57740 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NUP107P57740 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NUP107P57740 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NUP107P57740 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NUP107P57740 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NUP107P57740 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NUP107P57740 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NUP107P57740 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NUP107P57740 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NUP107P57740 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NUP107P57740 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NUP107P57740 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NUP107P57740 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NUP107P57740 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NUP107P57740 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NUP107P57740 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NUP107P57740 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NUP107P57740 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NUP107P57740 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NUP107P57740 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NUP107P57740 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NUP107P57740 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NUP107P57740 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NUP107P57740 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NUP107P57740 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NUP107P57740 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
NUP107P57740 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NUP107P57740 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NUP107P57740 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
NUP107P57740 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
NUP107P57740 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NUP107P57740 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms