Protein–RNA interactions for Protein: P49458

SRP9, Signal recognition particle 9 kDa protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 86 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRP9P49458 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SRP9P49458 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SRP9P49458 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SRP9P49458 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SRP9P49458 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SRP9P49458 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SRP9P49458 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SRP9P49458 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SRP9P49458 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SRP9P49458 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SRP9P49458 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SRP9P49458 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SRP9P49458 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SRP9P49458 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SRP9P49458 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SRP9P49458 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SRP9P49458 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SRP9P49458 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SRP9P49458 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SRP9P49458 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SRP9P49458 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SRP9P49458 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SRP9P49458 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SRP9P49458 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SRP9P49458 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SRP9P49458 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SRP9P49458 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SRP9P49458 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SRP9P49458 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SRP9P49458 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SRP9P49458 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SRP9P49458 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SRP9P49458 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SRP9P49458 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SRP9P49458 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SRP9P49458 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SRP9P49458 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SRP9P49458 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SRP9P49458 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SRP9P49458 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SRP9P49458 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SRP9P49458 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SRP9P49458 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
SRP9P49458 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
SRP9P49458 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SRP9P49458 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SRP9P49458 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SRP9P49458 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SRP9P49458 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
SRP9P49458 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SRP9P49458 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SRP9P49458 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
SRP9P49458 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SRP9P49458 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SRP9P49458 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SRP9P49458 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
SRP9P49458 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SRP9P49458 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SRP9P49458 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SRP9P49458 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SRP9P49458 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SRP9P49458 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SRP9P49458 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SRP9P49458 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SRP9P49458 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
SRP9P49458 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SRP9P49458 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SRP9P49458 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SRP9P49458 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SRP9P49458 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SRP9P49458 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SRP9P49458 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SRP9P49458 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SRP9P49458 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SRP9P49458 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SRP9P49458 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SRP9P49458 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SRP9P49458 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SRP9P49458 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SRP9P49458 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SRP9P49458 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SRP9P49458 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SRP9P49458 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SRP9P49458 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SRP9P49458 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SRP9P49458 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
SRP9P49458 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SRP9P49458 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SRP9P49458 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SRP9P49458 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SRP9P49458 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SRP9P49458 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SRP9P49458 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SRP9P49458 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SRP9P49458 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SRP9P49458 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SRP9P49458 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
SRP9P49458 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SRP9P49458 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
SRP9P49458 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
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