Protein–RNA interactions for Protein: P49247

RPIA, Ribose-5-phosphate isomerase, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPIAP49247 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RPIAP49247 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
RPIAP49247 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RPIAP49247 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RPIAP49247 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RPIAP49247 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RPIAP49247 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RPIAP49247 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
RPIAP49247 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RPIAP49247 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
RPIAP49247 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RPIAP49247 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
RPIAP49247 SERPINA7P1-201ENST00000443077 631 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
RPIAP49247 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
RPIAP49247 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
RPIAP49247 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
RPIAP49247 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
RPIAP49247 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
RPIAP49247 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
RPIAP49247 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
RPIAP49247 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RPIAP49247 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RPIAP49247 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RPIAP49247 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
RPIAP49247 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RPIAP49247 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RPIAP49247 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RPIAP49247 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RPIAP49247 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
RPIAP49247 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RPIAP49247 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RPIAP49247 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RPIAP49247 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
RPIAP49247 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RPIAP49247 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RPIAP49247 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RPIAP49247 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
RPIAP49247 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RPIAP49247 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RPIAP49247 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
RPIAP49247 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RPIAP49247 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RPIAP49247 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
RPIAP49247 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RPIAP49247 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RPIAP49247 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RPIAP49247 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
RPIAP49247 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RPIAP49247 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
RPIAP49247 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
RPIAP49247 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
RPIAP49247 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RPIAP49247 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
RPIAP49247 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
RPIAP49247 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RPIAP49247 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
RPIAP49247 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RPIAP49247 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RPIAP49247 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RPIAP49247 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RPIAP49247 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
RPIAP49247 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
RPIAP49247 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
RPIAP49247 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RPIAP49247 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RPIAP49247 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
RPIAP49247 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RPIAP49247 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RPIAP49247 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RPIAP49247 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
RPIAP49247 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RPIAP49247 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RPIAP49247 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
RPIAP49247 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
RPIAP49247 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RPIAP49247 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
RPIAP49247 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RPIAP49247 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RPIAP49247 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
RPIAP49247 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RPIAP49247 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RPIAP49247 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RPIAP49247 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RPIAP49247 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
RPIAP49247 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
RPIAP49247 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
RPIAP49247 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
RPIAP49247 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
RPIAP49247 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
RPIAP49247 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
RPIAP49247 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
RPIAP49247 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
RPIAP49247 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
RPIAP49247 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
RPIAP49247 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
RPIAP49247 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
RPIAP49247 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RPIAP49247 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RPIAP49247 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
RPIAP49247 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.3 ms