Protein–RNA interactions for Protein: P45974

USP5, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 5, humanhuman

Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP5P45974 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
USP5P45974 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
USP5P45974 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
USP5P45974 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
USP5P45974 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
USP5P45974 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
USP5P45974 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
USP5P45974 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
USP5P45974 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
USP5P45974 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
USP5P45974 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
USP5P45974 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
USP5P45974 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
USP5P45974 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
USP5P45974 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
USP5P45974 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
USP5P45974 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
USP5P45974 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
USP5P45974 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
USP5P45974 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
USP5P45974 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
USP5P45974 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
USP5P45974 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
USP5P45974 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
USP5P45974 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
USP5P45974 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
USP5P45974 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
USP5P45974 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
USP5P45974 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
USP5P45974 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
USP5P45974 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
USP5P45974 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
USP5P45974 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
USP5P45974 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
USP5P45974 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
USP5P45974 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
USP5P45974 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
USP5P45974 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
USP5P45974 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
USP5P45974 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
USP5P45974 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
USP5P45974 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
USP5P45974 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
USP5P45974 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
USP5P45974 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
USP5P45974 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
USP5P45974 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
USP5P45974 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
USP5P45974 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
USP5P45974 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
USP5P45974 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
USP5P45974 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
USP5P45974 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
USP5P45974 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
USP5P45974 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
USP5P45974 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC20.24■□□□□ 0.83
USP5P45974 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
USP5P45974 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
USP5P45974 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
USP5P45974 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
USP5P45974 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
USP5P45974 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
USP5P45974 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
USP5P45974 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
USP5P45974 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
USP5P45974 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
USP5P45974 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
USP5P45974 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
USP5P45974 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
USP5P45974 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
USP5P45974 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
USP5P45974 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
USP5P45974 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
USP5P45974 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
USP5P45974 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
USP5P45974 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
USP5P45974 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
USP5P45974 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
USP5P45974 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
USP5P45974 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
USP5P45974 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
USP5P45974 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
USP5P45974 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
USP5P45974 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
USP5P45974 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
USP5P45974 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
USP5P45974 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
USP5P45974 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
USP5P45974 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
USP5P45974 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
USP5P45974 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
USP5P45974 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
USP5P45974 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
USP5P45974 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC20.23■□□□□ 0.83
USP5P45974 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
USP5P45974 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
USP5P45974 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
USP5P45974 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
USP5P45974 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
USP5P45974 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.3 ms