Protein–RNA interactions for Protein: P43681

CHRNA4, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA4P43681 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CHRNA4P43681 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CHRNA4P43681 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CHRNA4P43681 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CHRNA4P43681 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CHRNA4P43681 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CHRNA4P43681 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CHRNA4P43681 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CHRNA4P43681 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CHRNA4P43681 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CHRNA4P43681 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CHRNA4P43681 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CHRNA4P43681 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CHRNA4P43681 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CHRNA4P43681 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CHRNA4P43681 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CHRNA4P43681 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CHRNA4P43681 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CHRNA4P43681 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CHRNA4P43681 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CHRNA4P43681 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CHRNA4P43681 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CHRNA4P43681 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CHRNA4P43681 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CHRNA4P43681 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CHRNA4P43681 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CHRNA4P43681 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CHRNA4P43681 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CHRNA4P43681 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CHRNA4P43681 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CHRNA4P43681 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CHRNA4P43681 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CHRNA4P43681 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CHRNA4P43681 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CHRNA4P43681 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CHRNA4P43681 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CHRNA4P43681 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CHRNA4P43681 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CHRNA4P43681 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CHRNA4P43681 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CHRNA4P43681 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CHRNA4P43681 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CHRNA4P43681 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CHRNA4P43681 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CHRNA4P43681 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CHRNA4P43681 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CHRNA4P43681 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CHRNA4P43681 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CHRNA4P43681 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CHRNA4P43681 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CHRNA4P43681 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CHRNA4P43681 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CHRNA4P43681 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CHRNA4P43681 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CHRNA4P43681 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CHRNA4P43681 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CHRNA4P43681 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CHRNA4P43681 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CHRNA4P43681 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CHRNA4P43681 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CHRNA4P43681 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CHRNA4P43681 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CHRNA4P43681 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CHRNA4P43681 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CHRNA4P43681 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CHRNA4P43681 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CHRNA4P43681 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CHRNA4P43681 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CHRNA4P43681 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CHRNA4P43681 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CHRNA4P43681 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CHRNA4P43681 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CHRNA4P43681 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CHRNA4P43681 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CHRNA4P43681 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CHRNA4P43681 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CHRNA4P43681 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CHRNA4P43681 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CHRNA4P43681 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CHRNA4P43681 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CHRNA4P43681 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CHRNA4P43681 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CHRNA4P43681 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CHRNA4P43681 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CHRNA4P43681 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CHRNA4P43681 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CHRNA4P43681 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CHRNA4P43681 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CHRNA4P43681 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CHRNA4P43681 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CHRNA4P43681 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CHRNA4P43681 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CHRNA4P43681 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CHRNA4P43681 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CHRNA4P43681 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CHRNA4P43681 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CHRNA4P43681 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CHRNA4P43681 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CHRNA4P43681 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CHRNA4P43681 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.4 ms