Protein–RNA interactions for Protein: P42857

NSG1, Neuron-specific protein family member 1, humanhuman

Predictions only

Length 185 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NSG1P42857 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
NSG1P42857 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
NSG1P42857 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
NSG1P42857 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
NSG1P42857 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NSG1P42857 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NSG1P42857 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NSG1P42857 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
NSG1P42857 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NSG1P42857 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
NSG1P42857 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NSG1P42857 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NSG1P42857 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NSG1P42857 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NSG1P42857 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NSG1P42857 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NSG1P42857 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NSG1P42857 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NSG1P42857 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NSG1P42857 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NSG1P42857 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
NSG1P42857 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NSG1P42857 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NSG1P42857 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NSG1P42857 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NSG1P42857 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NSG1P42857 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NSG1P42857 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NSG1P42857 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NSG1P42857 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NSG1P42857 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NSG1P42857 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NSG1P42857 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NSG1P42857 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NSG1P42857 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NSG1P42857 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NSG1P42857 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NSG1P42857 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NSG1P42857 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NSG1P42857 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NSG1P42857 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NSG1P42857 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NSG1P42857 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NSG1P42857 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
NSG1P42857 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NSG1P42857 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NSG1P42857 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NSG1P42857 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NSG1P42857 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NSG1P42857 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NSG1P42857 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NSG1P42857 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NSG1P42857 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NSG1P42857 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NSG1P42857 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NSG1P42857 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NSG1P42857 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NSG1P42857 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NSG1P42857 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NSG1P42857 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NSG1P42857 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NSG1P42857 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NSG1P42857 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NSG1P42857 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NSG1P42857 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NSG1P42857 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
NSG1P42857 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NSG1P42857 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NSG1P42857 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NSG1P42857 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
NSG1P42857 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
NSG1P42857 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NSG1P42857 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
NSG1P42857 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NSG1P42857 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NSG1P42857 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NSG1P42857 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NSG1P42857 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NSG1P42857 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NSG1P42857 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NSG1P42857 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NSG1P42857 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NSG1P42857 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NSG1P42857 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NSG1P42857 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NSG1P42857 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NSG1P42857 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NSG1P42857 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NSG1P42857 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NSG1P42857 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NSG1P42857 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NSG1P42857 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NSG1P42857 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NSG1P42857 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
NSG1P42857 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
NSG1P42857 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NSG1P42857 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NSG1P42857 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NSG1P42857 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NSG1P42857 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms