Protein–RNA interactions for Protein: P35222

CTNNB1, Catenin beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 781 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNB1P35222 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CTNNB1P35222 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CTNNB1P35222 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CTNNB1P35222 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CTNNB1P35222 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CTNNB1P35222 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CTNNB1P35222 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CTNNB1P35222 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CTNNB1P35222 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CTNNB1P35222 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CTNNB1P35222 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CTNNB1P35222 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CTNNB1P35222 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CTNNB1P35222 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CTNNB1P35222 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CTNNB1P35222 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CTNNB1P35222 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CTNNB1P35222 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CTNNB1P35222 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CTNNB1P35222 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CTNNB1P35222 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CTNNB1P35222 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CTNNB1P35222 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
CTNNB1P35222 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CTNNB1P35222 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CTNNB1P35222 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CTNNB1P35222 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CTNNB1P35222 AL132711.1-201ENST00000557546 722 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CTNNB1P35222 SNHG15-207ENST00000582727 1039 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CTNNB1P35222 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CTNNB1P35222 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CTNNB1P35222 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CTNNB1P35222 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CTNNB1P35222 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CTNNB1P35222 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CTNNB1P35222 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CTNNB1P35222 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CTNNB1P35222 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CTNNB1P35222 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
CTNNB1P35222 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CTNNB1P35222 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CTNNB1P35222 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CTNNB1P35222 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CTNNB1P35222 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CTNNB1P35222 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CTNNB1P35222 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CTNNB1P35222 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CTNNB1P35222 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CTNNB1P35222 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
CTNNB1P35222 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CTNNB1P35222 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CTNNB1P35222 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CTNNB1P35222 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CTNNB1P35222 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CTNNB1P35222 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CTNNB1P35222 DICER1-AS1-202ENST00000439819 810 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CTNNB1P35222 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CTNNB1P35222 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CTNNB1P35222 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CTNNB1P35222 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CTNNB1P35222 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CTNNB1P35222 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CTNNB1P35222 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CTNNB1P35222 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CTNNB1P35222 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
CTNNB1P35222 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CTNNB1P35222 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CTNNB1P35222 MIR6752-201ENST00000618442 71 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
CTNNB1P35222 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CTNNB1P35222 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CTNNB1P35222 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
CTNNB1P35222 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CTNNB1P35222 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CTNNB1P35222 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CTNNB1P35222 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CTNNB1P35222 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CTNNB1P35222 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CTNNB1P35222 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CTNNB1P35222 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CTNNB1P35222 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CTNNB1P35222 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CTNNB1P35222 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CTNNB1P35222 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
CTNNB1P35222 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
CTNNB1P35222 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.46
CTNNB1P35222 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CTNNB1P35222 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CTNNB1P35222 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CTNNB1P35222 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CTNNB1P35222 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CTNNB1P35222 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CTNNB1P35222 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CTNNB1P35222 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CTNNB1P35222 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CTNNB1P35222 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CTNNB1P35222 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CTNNB1P35222 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CTNNB1P35222 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CTNNB1P35222 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
CTNNB1P35222 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms