Protein–RNA interactions for Protein: P32969

RPL9, 60S ribosomal protein L9, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 192 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL9P32969 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RPL9P32969 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RPL9P32969 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RPL9P32969 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RPL9P32969 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RPL9P32969 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RPL9P32969 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RPL9P32969 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RPL9P32969 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RPL9P32969 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RPL9P32969 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
RPL9P32969 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RPL9P32969 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
RPL9P32969 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
RPL9P32969 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RPL9P32969 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RPL9P32969 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RPL9P32969 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RPL9P32969 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RPL9P32969 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RPL9P32969 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RPL9P32969 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RPL9P32969 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RPL9P32969 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RPL9P32969 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RPL9P32969 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RPL9P32969 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RPL9P32969 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RPL9P32969 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RPL9P32969 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RPL9P32969 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RPL9P32969 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RPL9P32969 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RPL9P32969 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RPL9P32969 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RPL9P32969 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
RPL9P32969 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RPL9P32969 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RPL9P32969 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RPL9P32969 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RPL9P32969 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
RPL9P32969 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RPL9P32969 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RPL9P32969 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RPL9P32969 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RPL9P32969 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RPL9P32969 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RPL9P32969 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RPL9P32969 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RPL9P32969 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RPL9P32969 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RPL9P32969 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RPL9P32969 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RPL9P32969 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RPL9P32969 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RPL9P32969 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RPL9P32969 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RPL9P32969 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RPL9P32969 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RPL9P32969 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RPL9P32969 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RPL9P32969 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RPL9P32969 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RPL9P32969 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
RPL9P32969 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RPL9P32969 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RPL9P32969 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RPL9P32969 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RPL9P32969 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RPL9P32969 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RPL9P32969 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RPL9P32969 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RPL9P32969 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RPL9P32969 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RPL9P32969 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RPL9P32969 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RPL9P32969 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RPL9P32969 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
RPL9P32969 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RPL9P32969 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RPL9P32969 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RPL9P32969 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
RPL9P32969 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RPL9P32969 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RPL9P32969 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RPL9P32969 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RPL9P32969 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RPL9P32969 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RPL9P32969 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RPL9P32969 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RPL9P32969 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RPL9P32969 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RPL9P32969 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RPL9P32969 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RPL9P32969 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RPL9P32969 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RPL9P32969 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RPL9P32969 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RPL9P32969 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RPL9P32969 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.7 ms