Protein–RNA interactions for Protein: P31415

CASQ1, Calsequestrin-1, humanhuman

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASQ1P31415 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CASQ1P31415 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CASQ1P31415 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CASQ1P31415 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CASQ1P31415 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CASQ1P31415 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CASQ1P31415 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
CASQ1P31415 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CASQ1P31415 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
CASQ1P31415 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CASQ1P31415 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CASQ1P31415 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
CASQ1P31415 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
CASQ1P31415 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CASQ1P31415 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CASQ1P31415 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
CASQ1P31415 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CASQ1P31415 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CASQ1P31415 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
CASQ1P31415 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CASQ1P31415 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
CASQ1P31415 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CASQ1P31415 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CASQ1P31415 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CASQ1P31415 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
CASQ1P31415 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CASQ1P31415 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
CASQ1P31415 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
CASQ1P31415 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CASQ1P31415 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CASQ1P31415 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CASQ1P31415 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CASQ1P31415 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CASQ1P31415 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CASQ1P31415 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CASQ1P31415 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CASQ1P31415 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CASQ1P31415 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CASQ1P31415 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CASQ1P31415 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CASQ1P31415 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CASQ1P31415 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CASQ1P31415 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
CASQ1P31415 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CASQ1P31415 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CASQ1P31415 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CASQ1P31415 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CASQ1P31415 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CASQ1P31415 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CASQ1P31415 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CASQ1P31415 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CASQ1P31415 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CASQ1P31415 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CASQ1P31415 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CASQ1P31415 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
CASQ1P31415 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
CASQ1P31415 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CASQ1P31415 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CASQ1P31415 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CASQ1P31415 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
CASQ1P31415 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CASQ1P31415 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CASQ1P31415 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
CASQ1P31415 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CASQ1P31415 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CASQ1P31415 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CASQ1P31415 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CASQ1P31415 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CASQ1P31415 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CASQ1P31415 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CASQ1P31415 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CASQ1P31415 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CASQ1P31415 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CASQ1P31415 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CASQ1P31415 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CASQ1P31415 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CASQ1P31415 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CASQ1P31415 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CASQ1P31415 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CASQ1P31415 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CASQ1P31415 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CASQ1P31415 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CASQ1P31415 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CASQ1P31415 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CASQ1P31415 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CASQ1P31415 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CASQ1P31415 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
CASQ1P31415 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CASQ1P31415 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CASQ1P31415 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CASQ1P31415 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CASQ1P31415 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
CASQ1P31415 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CASQ1P31415 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CASQ1P31415 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
CASQ1P31415 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CASQ1P31415 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CASQ1P31415 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CASQ1P31415 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CASQ1P31415 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms