Protein–RNA interactions for Protein: P22061

PCMT1, Protein-L-isoaspartate(D-aspartate) O-methyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCMT1P22061 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PCMT1P22061 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PCMT1P22061 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PCMT1P22061 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PCMT1P22061 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PCMT1P22061 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PCMT1P22061 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PCMT1P22061 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PCMT1P22061 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PCMT1P22061 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
PCMT1P22061 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PCMT1P22061 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PCMT1P22061 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PCMT1P22061 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PCMT1P22061 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PCMT1P22061 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PCMT1P22061 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PCMT1P22061 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PCMT1P22061 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PCMT1P22061 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PCMT1P22061 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PCMT1P22061 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PCMT1P22061 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PCMT1P22061 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PCMT1P22061 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PCMT1P22061 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PCMT1P22061 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PCMT1P22061 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PCMT1P22061 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PCMT1P22061 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PCMT1P22061 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PCMT1P22061 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PCMT1P22061 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PCMT1P22061 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PCMT1P22061 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PCMT1P22061 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PCMT1P22061 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PCMT1P22061 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PCMT1P22061 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PCMT1P22061 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PCMT1P22061 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PCMT1P22061 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PCMT1P22061 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PCMT1P22061 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PCMT1P22061 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PCMT1P22061 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PCMT1P22061 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PCMT1P22061 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PCMT1P22061 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PCMT1P22061 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PCMT1P22061 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PCMT1P22061 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PCMT1P22061 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PCMT1P22061 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PCMT1P22061 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PCMT1P22061 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PCMT1P22061 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PCMT1P22061 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PCMT1P22061 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PCMT1P22061 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PCMT1P22061 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PCMT1P22061 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PCMT1P22061 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PCMT1P22061 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PCMT1P22061 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PCMT1P22061 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PCMT1P22061 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PCMT1P22061 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PCMT1P22061 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
PCMT1P22061 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PCMT1P22061 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PCMT1P22061 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PCMT1P22061 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PCMT1P22061 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
PCMT1P22061 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PCMT1P22061 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PCMT1P22061 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PCMT1P22061 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PCMT1P22061 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PCMT1P22061 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PCMT1P22061 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
PCMT1P22061 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PCMT1P22061 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PCMT1P22061 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PCMT1P22061 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PCMT1P22061 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PCMT1P22061 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PCMT1P22061 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PCMT1P22061 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PCMT1P22061 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PCMT1P22061 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PCMT1P22061 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PCMT1P22061 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PCMT1P22061 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PCMT1P22061 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PCMT1P22061 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
PCMT1P22061 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PCMT1P22061 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PCMT1P22061 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PCMT1P22061 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.1 ms