Protein–RNA interactions for Protein: P20339

RAB5A, Ras-related protein Rab-5A, humanhuman

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Length 215 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB5AP20339 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
RAB5AP20339 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC13.25□□□□□ -0.29
RAB5AP20339 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
RAB5AP20339 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
RAB5AP20339 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
RAB5AP20339 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
RAB5AP20339 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
RAB5AP20339 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
RAB5AP20339 ICA1-207ENST00000406470 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
RAB5AP20339 SLC22A15-202ENST00000369503 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
RAB5AP20339 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
RAB5AP20339 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
RAB5AP20339 RPS6KL1-210ENST00000555647 3309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
RAB5AP20339 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
RAB5AP20339 PODN-207ENST00000618387 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
RAB5AP20339 SLC4A7-212ENST00000446700 4000 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
RAB5AP20339 AC104836.1-202ENST00000636805 6041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
RAB5AP20339 FADS2-201ENST00000257261 2964 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
RAB5AP20339 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
RAB5AP20339 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
RAB5AP20339 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
RAB5AP20339 FHDC1-202ENST00000511601 6583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
RAB5AP20339 HSD17B4-206ENST00000504811 2740 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
RAB5AP20339 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
RAB5AP20339 CEP131-203ENST00000450824 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
RAB5AP20339 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
RAB5AP20339 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
RAB5AP20339 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
RAB5AP20339 AGBL3-202ENST00000435976 2495 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
RAB5AP20339 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
RAB5AP20339 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
RAB5AP20339 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
RAB5AP20339 RBM47-203ENST00000381795 4473 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
RAB5AP20339 PRSS30P-203ENST00000476276 2855 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
RAB5AP20339 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
RAB5AP20339 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
RAB5AP20339 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
RAB5AP20339 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
RAB5AP20339 RAB11FIP1-201ENST00000287263 6253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
RAB5AP20339 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
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RAB5AP20339 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
RAB5AP20339 EDIL3-201ENST00000296591 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
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RAB5AP20339 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
RAB5AP20339 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
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RAB5AP20339 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
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RAB5AP20339 KIRREL3-202ENST00000525704 2474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
RAB5AP20339 SIMC1-205ENST00000443967 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
RAB5AP20339 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
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RAB5AP20339 DESI2-202ENST00000302550 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
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RAB5AP20339 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
RAB5AP20339 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
RAB5AP20339 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
RAB5AP20339 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
RAB5AP20339 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
RAB5AP20339 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
RAB5AP20339 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
RAB5AP20339 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
RAB5AP20339 SPATS2L-209ENST00000409988 2698 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
RAB5AP20339 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
RAB5AP20339 ERLIN2-205ENST00000518586 2623 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
RAB5AP20339 PDE1B-207ENST00000550620 2150 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
RAB5AP20339 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
RAB5AP20339 UNC5B-202ENST00000373192 6451 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
RAB5AP20339 CNTNAP3P2-201ENST00000617175 3861 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
RAB5AP20339 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
RAB5AP20339 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
RAB5AP20339 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
RAB5AP20339 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
RAB5AP20339 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
RAB5AP20339 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
RAB5AP20339 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
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