Protein–RNA interactions for Protein: P16219

ACADS, Short-chain specific acyl-CoA dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACADSP16219 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ACADSP16219 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ACADSP16219 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ACADSP16219 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ACADSP16219 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ACADSP16219 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ACADSP16219 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ACADSP16219 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ACADSP16219 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ACADSP16219 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ACADSP16219 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ACADSP16219 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ACADSP16219 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ACADSP16219 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ACADSP16219 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACADSP16219 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACADSP16219 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACADSP16219 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACADSP16219 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACADSP16219 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACADSP16219 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACADSP16219 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACADSP16219 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACADSP16219 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACADSP16219 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACADSP16219 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACADSP16219 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
ACADSP16219 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACADSP16219 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
ACADSP16219 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACADSP16219 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACADSP16219 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACADSP16219 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACADSP16219 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
ACADSP16219 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACADSP16219 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACADSP16219 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACADSP16219 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACADSP16219 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACADSP16219 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACADSP16219 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACADSP16219 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACADSP16219 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACADSP16219 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACADSP16219 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACADSP16219 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACADSP16219 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACADSP16219 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
ACADSP16219 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACADSP16219 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACADSP16219 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACADSP16219 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACADSP16219 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACADSP16219 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACADSP16219 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ACADSP16219 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ACADSP16219 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ACADSP16219 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ACADSP16219 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ACADSP16219 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ACADSP16219 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ACADSP16219 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ACADSP16219 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ACADSP16219 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ACADSP16219 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ACADSP16219 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ACADSP16219 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ACADSP16219 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ACADSP16219 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ACADSP16219 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ACADSP16219 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ACADSP16219 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ACADSP16219 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ACADSP16219 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ACADSP16219 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ACADSP16219 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ACADSP16219 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ACADSP16219 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ACADSP16219 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ACADSP16219 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ACADSP16219 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ACADSP16219 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ACADSP16219 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ACADSP16219 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ACADSP16219 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ACADSP16219 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ACADSP16219 RGPD6-202ENST00000330331 2848 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ACADSP16219 RGPD8-202ENST00000330575 2848 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ACADSP16219 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ACADSP16219 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ACADSP16219 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ACADSP16219 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ACADSP16219 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ACADSP16219 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ACADSP16219 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ACADSP16219 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ACADSP16219 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ACADSP16219 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ACADSP16219 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ACADSP16219 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.2 ms