Protein–RNA interactions for Protein: P0C2W7

CT47B1, Cancer/testis antigen 47B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CT47B1P0C2W7 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CT47B1P0C2W7 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CT47B1P0C2W7 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CT47B1P0C2W7 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CT47B1P0C2W7 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CT47B1P0C2W7 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CT47B1P0C2W7 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CT47B1P0C2W7 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CT47B1P0C2W7 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CT47B1P0C2W7 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CT47B1P0C2W7 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CT47B1P0C2W7 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CT47B1P0C2W7 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CT47B1P0C2W7 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CT47B1P0C2W7 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CT47B1P0C2W7 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CT47B1P0C2W7 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CT47B1P0C2W7 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CT47B1P0C2W7 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CT47B1P0C2W7 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CT47B1P0C2W7 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CT47B1P0C2W7 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CT47B1P0C2W7 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CT47B1P0C2W7 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
CT47B1P0C2W7 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
CT47B1P0C2W7 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
CT47B1P0C2W7 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CT47B1P0C2W7 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CT47B1P0C2W7 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CT47B1P0C2W7 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CT47B1P0C2W7 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CT47B1P0C2W7 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CT47B1P0C2W7 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CT47B1P0C2W7 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CT47B1P0C2W7 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CT47B1P0C2W7 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CT47B1P0C2W7 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CT47B1P0C2W7 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CT47B1P0C2W7 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CT47B1P0C2W7 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CT47B1P0C2W7 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CT47B1P0C2W7 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CT47B1P0C2W7 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CT47B1P0C2W7 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
CT47B1P0C2W7 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CT47B1P0C2W7 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
CT47B1P0C2W7 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CT47B1P0C2W7 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CT47B1P0C2W7 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CT47B1P0C2W7 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CT47B1P0C2W7 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CT47B1P0C2W7 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CT47B1P0C2W7 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CT47B1P0C2W7 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CT47B1P0C2W7 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CT47B1P0C2W7 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CT47B1P0C2W7 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CT47B1P0C2W7 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CT47B1P0C2W7 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CT47B1P0C2W7 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CT47B1P0C2W7 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CT47B1P0C2W7 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CT47B1P0C2W7 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CT47B1P0C2W7 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CT47B1P0C2W7 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CT47B1P0C2W7 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CT47B1P0C2W7 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CT47B1P0C2W7 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CT47B1P0C2W7 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CT47B1P0C2W7 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CT47B1P0C2W7 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CT47B1P0C2W7 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CT47B1P0C2W7 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CT47B1P0C2W7 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CT47B1P0C2W7 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CT47B1P0C2W7 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
CT47B1P0C2W7 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CT47B1P0C2W7 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CT47B1P0C2W7 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
CT47B1P0C2W7 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CT47B1P0C2W7 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CT47B1P0C2W7 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CT47B1P0C2W7 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CT47B1P0C2W7 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CT47B1P0C2W7 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CT47B1P0C2W7 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CT47B1P0C2W7 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CT47B1P0C2W7 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
CT47B1P0C2W7 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CT47B1P0C2W7 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.7■■□□□ 1.07
CT47B1P0C2W7 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.07
CT47B1P0C2W7 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CT47B1P0C2W7 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CT47B1P0C2W7 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CT47B1P0C2W7 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CT47B1P0C2W7 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CT47B1P0C2W7 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CT47B1P0C2W7 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CT47B1P0C2W7 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CT47B1P0C2W7 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.3 ms