Protein–RNA interactions for Protein: P08F94

PKHD1, Fibrocystin, humanhuman

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Length 4,074 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKHD1P08F94 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
PKHD1P08F94 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
PKHD1P08F94 OCEL1-201ENST00000215061 1133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
PKHD1P08F94 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
PKHD1P08F94 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
PKHD1P08F94 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
PKHD1P08F94 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
PKHD1P08F94 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
PKHD1P08F94 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
PKHD1P08F94 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
PKHD1P08F94 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
PKHD1P08F94 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC10.74□□□□□ -0.69
PKHD1P08F94 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
PKHD1P08F94 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
PKHD1P08F94 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
PKHD1P08F94 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC10.74□□□□□ -0.69
PKHD1P08F94 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
PKHD1P08F94 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
PKHD1P08F94 AC007405.2-202ENST00000418106 540 ntTSL 4 BASIC10.74□□□□□ -0.69
PKHD1P08F94 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
PKHD1P08F94 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
PKHD1P08F94 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
PKHD1P08F94 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
PKHD1P08F94 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
PKHD1P08F94 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
PKHD1P08F94 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
PKHD1P08F94 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
PKHD1P08F94 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
PKHD1P08F94 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
PKHD1P08F94 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
PKHD1P08F94 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
PKHD1P08F94 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
PKHD1P08F94 SETD4-205ENST00000399208 1165 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
PKHD1P08F94 MPV17-206ENST00000402722 827 ntTSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
PKHD1P08F94 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
PKHD1P08F94 SPECC1-223ENST00000584527 940 ntTSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
PKHD1P08F94 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
PKHD1P08F94 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
PKHD1P08F94 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
PKHD1P08F94 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
PKHD1P08F94 ITPA-201ENST00000380113 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
PKHD1P08F94 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
PKHD1P08F94 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
PKHD1P08F94 AC010641.1-201ENST00000591757 529 ntTSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
PKHD1P08F94 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
PKHD1P08F94 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
PKHD1P08F94 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
PKHD1P08F94 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
PKHD1P08F94 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
PKHD1P08F94 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
PKHD1P08F94 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC10.73□□□□□ -0.69
PKHD1P08F94 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
PKHD1P08F94 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
PKHD1P08F94 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
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PKHD1P08F94 MDP1-202ENST00000396833 582 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
PKHD1P08F94 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
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PKHD1P08F94 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
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PKHD1P08F94 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
PKHD1P08F94 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
PKHD1P08F94 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
PKHD1P08F94 UPK3A-201ENST00000216211 1051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
PKHD1P08F94 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
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PKHD1P08F94 RPL7P3-201ENST00000441388 714 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
PKHD1P08F94 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC10.72□□□□□ -0.69
PKHD1P08F94 AC133552.6-201ENST00000613406 534 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
PKHD1P08F94 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
PKHD1P08F94 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
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PKHD1P08F94 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
PKHD1P08F94 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
PKHD1P08F94 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
PKHD1P08F94 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
PKHD1P08F94 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
PKHD1P08F94 AC092506.1-202ENST00000401022 528 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
PKHD1P08F94 AC108725.1-201ENST00000495472 409 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
PKHD1P08F94 ROPN1B-210ENST00000514116 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
PKHD1P08F94 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
PKHD1P08F94 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC10.72□□□□□ -0.69
PKHD1P08F94 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
PKHD1P08F94 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
PKHD1P08F94 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
PKHD1P08F94 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
PKHD1P08F94 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
PKHD1P08F94 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
PKHD1P08F94 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
PKHD1P08F94 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
PKHD1P08F94 MORN2-204ENST00000409665 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
PKHD1P08F94 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
PKHD1P08F94 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
PKHD1P08F94 LINC00642-202ENST00000442515 670 ntTSL 3 BASIC10.72□□□□□ -0.69
PKHD1P08F94 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC10.72□□□□□ -0.69
PKHD1P08F94 YIF1A-210ENST00000496746 667 ntTSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
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