Protein–RNA interactions for Protein: P07197

NEFM, Neurofilament medium polypeptide, humanhuman

Predictions only

Length 916 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEFMP07197 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NEFMP07197 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NEFMP07197 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NEFMP07197 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NEFMP07197 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NEFMP07197 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NEFMP07197 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NEFMP07197 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NEFMP07197 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NEFMP07197 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NEFMP07197 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NEFMP07197 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NEFMP07197 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NEFMP07197 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NEFMP07197 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NEFMP07197 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NEFMP07197 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NEFMP07197 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NEFMP07197 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NEFMP07197 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NEFMP07197 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
NEFMP07197 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NEFMP07197 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NEFMP07197 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NEFMP07197 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NEFMP07197 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NEFMP07197 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NEFMP07197 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NEFMP07197 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NEFMP07197 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NEFMP07197 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NEFMP07197 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NEFMP07197 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NEFMP07197 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NEFMP07197 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NEFMP07197 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NEFMP07197 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NEFMP07197 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NEFMP07197 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NEFMP07197 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NEFMP07197 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NEFMP07197 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NEFMP07197 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NEFMP07197 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NEFMP07197 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NEFMP07197 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
NEFMP07197 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NEFMP07197 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NEFMP07197 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
NEFMP07197 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NEFMP07197 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
NEFMP07197 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NEFMP07197 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NEFMP07197 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NEFMP07197 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NEFMP07197 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NEFMP07197 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NEFMP07197 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NEFMP07197 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
NEFMP07197 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
NEFMP07197 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
NEFMP07197 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NEFMP07197 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NEFMP07197 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NEFMP07197 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NEFMP07197 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NEFMP07197 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NEFMP07197 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NEFMP07197 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NEFMP07197 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NEFMP07197 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NEFMP07197 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
NEFMP07197 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NEFMP07197 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NEFMP07197 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NEFMP07197 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
NEFMP07197 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NEFMP07197 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NEFMP07197 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NEFMP07197 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
NEFMP07197 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NEFMP07197 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NEFMP07197 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NEFMP07197 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NEFMP07197 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NEFMP07197 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NEFMP07197 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NEFMP07197 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NEFMP07197 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NEFMP07197 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NEFMP07197 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NEFMP07197 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NEFMP07197 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NEFMP07197 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NEFMP07197 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
NEFMP07197 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
NEFMP07197 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
NEFMP07197 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
NEFMP07197 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
NEFMP07197 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44 ms