Protein–RNA interactions for Protein: P06756

ITGAV, Integrin alpha-V, humanhuman

Predictions only

Length 1,048 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGAVP06756 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ITGAVP06756 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ITGAVP06756 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ITGAVP06756 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ITGAVP06756 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ITGAVP06756 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ITGAVP06756 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ITGAVP06756 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ITGAVP06756 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ITGAVP06756 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ITGAVP06756 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ITGAVP06756 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ITGAVP06756 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ITGAVP06756 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ITGAVP06756 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ITGAVP06756 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ITGAVP06756 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ITGAVP06756 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ITGAVP06756 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ITGAVP06756 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ITGAVP06756 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ITGAVP06756 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ITGAVP06756 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ITGAVP06756 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ITGAVP06756 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ITGAVP06756 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ITGAVP06756 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ITGAVP06756 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
ITGAVP06756 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ITGAVP06756 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
ITGAVP06756 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ITGAVP06756 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ITGAVP06756 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ITGAVP06756 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ITGAVP06756 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ITGAVP06756 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ITGAVP06756 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ITGAVP06756 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ITGAVP06756 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ITGAVP06756 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ITGAVP06756 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ITGAVP06756 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ITGAVP06756 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ITGAVP06756 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ITGAVP06756 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ITGAVP06756 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ITGAVP06756 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ITGAVP06756 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ITGAVP06756 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ITGAVP06756 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ITGAVP06756 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ITGAVP06756 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ITGAVP06756 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ITGAVP06756 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ITGAVP06756 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ITGAVP06756 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ITGAVP06756 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
ITGAVP06756 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ITGAVP06756 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ITGAVP06756 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ITGAVP06756 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ITGAVP06756 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ITGAVP06756 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ITGAVP06756 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ITGAVP06756 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ITGAVP06756 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ITGAVP06756 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ITGAVP06756 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ITGAVP06756 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ITGAVP06756 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ITGAVP06756 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ITGAVP06756 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ITGAVP06756 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ITGAVP06756 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ITGAVP06756 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ITGAVP06756 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ITGAVP06756 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ITGAVP06756 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ITGAVP06756 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ITGAVP06756 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ITGAVP06756 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ITGAVP06756 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ITGAVP06756 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
ITGAVP06756 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
ITGAVP06756 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
ITGAVP06756 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ITGAVP06756 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ITGAVP06756 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ITGAVP06756 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
ITGAVP06756 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ITGAVP06756 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ITGAVP06756 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ITGAVP06756 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ITGAVP06756 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ITGAVP06756 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ITGAVP06756 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ITGAVP06756 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
ITGAVP06756 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ITGAVP06756 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ITGAVP06756 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.3 ms