Protein–RNA interactions for Protein: P05107

ITGB2, Integrin beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 769 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB2P05107 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ITGB2P05107 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ITGB2P05107 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ITGB2P05107 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ITGB2P05107 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ITGB2P05107 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ITGB2P05107 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ITGB2P05107 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ITGB2P05107 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ITGB2P05107 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ITGB2P05107 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ITGB2P05107 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ITGB2P05107 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ITGB2P05107 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
ITGB2P05107 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
ITGB2P05107 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ITGB2P05107 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ITGB2P05107 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
ITGB2P05107 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
ITGB2P05107 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ITGB2P05107 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ITGB2P05107 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ITGB2P05107 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ITGB2P05107 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ITGB2P05107 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ITGB2P05107 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ITGB2P05107 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ITGB2P05107 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ITGB2P05107 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ITGB2P05107 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ITGB2P05107 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ITGB2P05107 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ITGB2P05107 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ITGB2P05107 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ITGB2P05107 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ITGB2P05107 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
ITGB2P05107 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ITGB2P05107 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ITGB2P05107 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ITGB2P05107 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ITGB2P05107 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ITGB2P05107 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ITGB2P05107 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ITGB2P05107 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ITGB2P05107 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ITGB2P05107 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ITGB2P05107 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
ITGB2P05107 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ITGB2P05107 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ITGB2P05107 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ITGB2P05107 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ITGB2P05107 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ITGB2P05107 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
ITGB2P05107 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ITGB2P05107 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ITGB2P05107 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ITGB2P05107 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
ITGB2P05107 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
ITGB2P05107 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ITGB2P05107 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ITGB2P05107 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
ITGB2P05107 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
ITGB2P05107 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ITGB2P05107 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ITGB2P05107 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ITGB2P05107 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
ITGB2P05107 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ITGB2P05107 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
ITGB2P05107 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
ITGB2P05107 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ITGB2P05107 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ITGB2P05107 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ITGB2P05107 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ITGB2P05107 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ITGB2P05107 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ITGB2P05107 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ITGB2P05107 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ITGB2P05107 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ITGB2P05107 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ITGB2P05107 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
ITGB2P05107 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ITGB2P05107 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ITGB2P05107 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ITGB2P05107 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ITGB2P05107 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ITGB2P05107 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ITGB2P05107 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ITGB2P05107 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ITGB2P05107 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ITGB2P05107 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ITGB2P05107 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ITGB2P05107 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ITGB2P05107 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ITGB2P05107 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ITGB2P05107 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ITGB2P05107 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
ITGB2P05107 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ITGB2P05107 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ITGB2P05107 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ITGB2P05107 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.9 ms