Protein–RNA interactions for Protein: P02776

PF4, Platelet factor 4, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PF4P02776 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
PF4P02776 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PF4P02776 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
PF4P02776 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PF4P02776 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PF4P02776 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PF4P02776 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PF4P02776 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PF4P02776 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PF4P02776 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PF4P02776 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PF4P02776 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
PF4P02776 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PF4P02776 NFATC4-204ENST00000424781 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PF4P02776 PIK3R1-211ENST00000521381 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PF4P02776 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PF4P02776 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
PF4P02776 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PF4P02776 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PF4P02776 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PF4P02776 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PF4P02776 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PF4P02776 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PF4P02776 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PF4P02776 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PF4P02776 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PF4P02776 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PF4P02776 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PF4P02776 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PF4P02776 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
PF4P02776 ELFN2-201ENST00000402918 8361 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PF4P02776 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PF4P02776 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PF4P02776 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PF4P02776 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PF4P02776 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PF4P02776 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PF4P02776 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PF4P02776 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PF4P02776 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
PF4P02776 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PF4P02776 DIP2A-201ENST00000400274 7023 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PF4P02776 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PF4P02776 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PF4P02776 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
PF4P02776 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PF4P02776 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PF4P02776 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PF4P02776 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PF4P02776 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PF4P02776 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PF4P02776 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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PF4P02776 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
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PF4P02776 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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PF4P02776 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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PF4P02776 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PF4P02776 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
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PF4P02776 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC13.12□□□□□ -0.31
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PF4P02776 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PF4P02776 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PF4P02776 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PF4P02776 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PF4P02776 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PF4P02776 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
PF4P02776 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
PF4P02776 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
PF4P02776 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PF4P02776 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PF4P02776 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PF4P02776 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PF4P02776 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PF4P02776 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PF4P02776 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PF4P02776 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PF4P02776 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
PF4P02776 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
PF4P02776 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
PF4P02776 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
PF4P02776 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
PF4P02776 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
PF4P02776 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
PF4P02776 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PF4P02776 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
PF4P02776 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
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