Protein–RNA interactions for Protein: O96006

ZBED1, Zinc finger BED domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 694 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED1O96006 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZBED1O96006 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZBED1O96006 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZBED1O96006 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZBED1O96006 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZBED1O96006 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZBED1O96006 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZBED1O96006 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZBED1O96006 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZBED1O96006 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZBED1O96006 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZBED1O96006 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZBED1O96006 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ZBED1O96006 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ZBED1O96006 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ZBED1O96006 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ZBED1O96006 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ZBED1O96006 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ZBED1O96006 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ZBED1O96006 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ZBED1O96006 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ZBED1O96006 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC18■□□□□ 0.47
ZBED1O96006 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ZBED1O96006 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ZBED1O96006 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ZBED1O96006 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ZBED1O96006 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ZBED1O96006 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ZBED1O96006 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ZBED1O96006 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
ZBED1O96006 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
ZBED1O96006 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ZBED1O96006 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
ZBED1O96006 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
ZBED1O96006 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ZBED1O96006 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ZBED1O96006 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ZBED1O96006 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ZBED1O96006 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ZBED1O96006 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ZBED1O96006 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ZBED1O96006 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ZBED1O96006 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ZBED1O96006 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
ZBED1O96006 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZBED1O96006 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZBED1O96006 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZBED1O96006 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZBED1O96006 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZBED1O96006 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZBED1O96006 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZBED1O96006 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZBED1O96006 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
ZBED1O96006 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZBED1O96006 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZBED1O96006 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZBED1O96006 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZBED1O96006 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZBED1O96006 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZBED1O96006 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZBED1O96006 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZBED1O96006 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZBED1O96006 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZBED1O96006 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZBED1O96006 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZBED1O96006 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZBED1O96006 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZBED1O96006 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZBED1O96006 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZBED1O96006 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZBED1O96006 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZBED1O96006 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZBED1O96006 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZBED1O96006 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZBED1O96006 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZBED1O96006 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZBED1O96006 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZBED1O96006 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZBED1O96006 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZBED1O96006 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZBED1O96006 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ZBED1O96006 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ZBED1O96006 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ZBED1O96006 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ZBED1O96006 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ZBED1O96006 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ZBED1O96006 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ZBED1O96006 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ZBED1O96006 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ZBED1O96006 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ZBED1O96006 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ZBED1O96006 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ZBED1O96006 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ZBED1O96006 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ZBED1O96006 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ZBED1O96006 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ZBED1O96006 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ZBED1O96006 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ZBED1O96006 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ZBED1O96006 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
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