Protein–RNA interactions for Protein: O60437

PPL, Periplakin, humanhuman

Predictions only

Length 1,756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPLO60437 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PPLO60437 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
PPLO60437 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PPLO60437 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PPLO60437 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
PPLO60437 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
PPLO60437 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PPLO60437 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PPLO60437 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PPLO60437 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
PPLO60437 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PPLO60437 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PPLO60437 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PPLO60437 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PPLO60437 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PPLO60437 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PPLO60437 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PPLO60437 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PPLO60437 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
PPLO60437 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PPLO60437 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PPLO60437 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PPLO60437 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
PPLO60437 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PPLO60437 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PPLO60437 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PPLO60437 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PPLO60437 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PPLO60437 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PPLO60437 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PPLO60437 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PPLO60437 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PPLO60437 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PPLO60437 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PPLO60437 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PPLO60437 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PPLO60437 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PPLO60437 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PPLO60437 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PPLO60437 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PPLO60437 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PPLO60437 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
PPLO60437 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
PPLO60437 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PPLO60437 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PPLO60437 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PPLO60437 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PPLO60437 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PPLO60437 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PPLO60437 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PPLO60437 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PPLO60437 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PPLO60437 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PPLO60437 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PPLO60437 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PPLO60437 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PPLO60437 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PPLO60437 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PPLO60437 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PPLO60437 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PPLO60437 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PPLO60437 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PPLO60437 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PPLO60437 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PPLO60437 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PPLO60437 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PPLO60437 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
PPLO60437 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PPLO60437 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PPLO60437 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PPLO60437 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PPLO60437 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
PPLO60437 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
PPLO60437 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PPLO60437 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PPLO60437 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
PPLO60437 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PPLO60437 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PPLO60437 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PPLO60437 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PPLO60437 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PPLO60437 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PPLO60437 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PPLO60437 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PPLO60437 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PPLO60437 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PPLO60437 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PPLO60437 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PPLO60437 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PPLO60437 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PPLO60437 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PPLO60437 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PPLO60437 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PPLO60437 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PPLO60437 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PPLO60437 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PPLO60437 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PPLO60437 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PPLO60437 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PPLO60437 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms