Protein–RNA interactions for Protein: O43567

RNF13, E3 ubiquitin-protein ligase RNF13, humanhuman

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF13O43567 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RNF13O43567 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RNF13O43567 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RNF13O43567 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RNF13O43567 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
RNF13O43567 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RNF13O43567 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RNF13O43567 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RNF13O43567 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RNF13O43567 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RNF13O43567 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RNF13O43567 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RNF13O43567 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RNF13O43567 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RNF13O43567 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RNF13O43567 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RNF13O43567 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
RNF13O43567 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RNF13O43567 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RNF13O43567 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RNF13O43567 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RNF13O43567 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RNF13O43567 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RNF13O43567 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RNF13O43567 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RNF13O43567 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RNF13O43567 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RNF13O43567 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RNF13O43567 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RNF13O43567 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RNF13O43567 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RNF13O43567 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RNF13O43567 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RNF13O43567 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RNF13O43567 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RNF13O43567 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RNF13O43567 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RNF13O43567 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RNF13O43567 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RNF13O43567 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RNF13O43567 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RNF13O43567 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RNF13O43567 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RNF13O43567 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RNF13O43567 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RNF13O43567 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RNF13O43567 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RNF13O43567 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RNF13O43567 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RNF13O43567 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RNF13O43567 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RNF13O43567 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RNF13O43567 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RNF13O43567 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RNF13O43567 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RNF13O43567 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RNF13O43567 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RNF13O43567 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RNF13O43567 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RNF13O43567 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RNF13O43567 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RNF13O43567 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RNF13O43567 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RNF13O43567 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RNF13O43567 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RNF13O43567 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RNF13O43567 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RNF13O43567 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RNF13O43567 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RNF13O43567 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RNF13O43567 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RNF13O43567 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RNF13O43567 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RNF13O43567 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RNF13O43567 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RNF13O43567 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RNF13O43567 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RNF13O43567 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RNF13O43567 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RNF13O43567 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RNF13O43567 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RNF13O43567 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RNF13O43567 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RNF13O43567 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RNF13O43567 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RNF13O43567 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RNF13O43567 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RNF13O43567 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
RNF13O43567 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RNF13O43567 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RNF13O43567 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RNF13O43567 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RNF13O43567 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RNF13O43567 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RNF13O43567 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RNF13O43567 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
RNF13O43567 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RNF13O43567 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RNF13O43567 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RNF13O43567 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 115 ms