Protein–RNA interactions for Protein: O43172

PRPF4, U4/U6 small nuclear ribonucleoprotein Prp4, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 522 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF4O43172 TAF9-202ENST00000328663 1461 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.153e-6■■□□□ 12
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PRPF4O43172 AK6-201ENST00000380818 1183 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.163e-6■■□□□ 12
PRPF4O43172 C2-212ENST00000482060 2335 ntTSL 213.6□□□□□ -0.233e-6■■□□□ 12
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PRPF4O43172 RNF43-201ENST00000407977 5516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.253e-6■■□□□ 12
PRPF4O43172 PIDD1-203ENST00000524486 3917 ntTSL 213.41□□□□□ -0.264e-6■■□□□ 12
PRPF4O43172 PIDD1-210ENST00000534525 3994 ntTSL 213.25□□□□□ -0.294e-6■■□□□ 12
PRPF4O43172 SOX13-203ENST00000367204 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.313e-6■■□□□ 12
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PRPF4O43172 CDC6-201ENST00000209728 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.343e-6■■□□□ 12
PRPF4O43172 C2-211ENST00000469372 1906 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.353e-6■■□□□ 12
PRPF4O43172 WWOX-206ENST00000561846 769 ntTSL 312.84□□□□□ -0.353e-6■■□□□ 12
PRPF4O43172 DDB2-201ENST00000256996 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.363e-6■■□□□ 12
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PRPF4O43172 JMJD4-204ENST00000480590 891 ntTSL 212.16□□□□□ -0.463e-6■■□□□ 12
PRPF4O43172 CSE1L-201ENST00000262982 3553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.483e-6■■□□□ 12
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PRPF4O43172 CSE1L-202ENST00000396192 3459 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.593e-6■■□□□ 12
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PRPF4O43172 DDB2-204ENST00000378603 1092 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.673e-6■■□□□ 12
PRPF4O43172 DDB2-211ENST00000616278 960 ntTSL 210.86□□□□□ -0.673e-6■■□□□ 12
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PRPF4O43172 MLH1-216ENST00000458205 2608 ntTSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.043e-6■■□□□ 12
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PRPF4O43172 EZH1-201ENST00000415827 4608 ntTSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.093e-6■■□□□ 12
PRPF4O43172 TMEM192-201ENST00000306480 10012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.123e-6■■□□□ 12
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PRPF4O43172 EZH1-202ENST00000428826 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.283e-6■■□□□ 12
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PRPF4O43172 MLH1-212ENST00000455445 2296 ntTSL 2 BASIC4.43□□□□□ -1.73e-6■■□□□ 12
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PRPF4O43172 EZH1-224ENST00000593214 745 ntTSL 54.39□□□□□ -1.713e-6■■□□□ 12
PRPF4O43172 FAR2P4-202ENST00000425399 584 ntBASIC4.35□□□□□ -1.713e-6■■□□□ 12
PRPF4O43172 CDK12-206ENST00000581593 559 ntTSL 34.24□□□□□ -1.733e-6■■□□□ 12
PRPF4O43172 ACBD3-202ENST00000464927 294 ntTSL 23.11□□□□□ -1.913e-6■■□□□ 12
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PRPF4O43172 TMC6-206ENST00000586271 970 ntTSL 218.58■□□□□ 0.568e-8■■□□□ 12
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PRPF4O43172 SMAD2-207ENST00000586514 828 ntTSL 515.19■□□□□ 0.024e-9■■□□□ 12
PRPF4O43172 SMAD2-212ENST00000591214 1714 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.044e-9■■□□□ 12
PRPF4O43172 SMAD2-203ENST00000402690 12075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.214e-9■■□□□ 12
PRPF4O43172 SMAD2-210ENST00000587421 575 ntTSL 413.08□□□□□ -0.324e-9■■□□□ 12
PRPF4O43172 MAN2C1-208ENST00000562461 591 ntTSL 414.44□□□□□ -0.19e-8■■□□□ 12
PRPF4O43172 CTBP1-214ENST00000514495 564 ntTSL 226.33■■□□□ 1.818e-7■■□□□ 11.9
PRPF4O43172 CTBP1-217ENST00000515399 985 ntTSL 318.7■□□□□ 0.588e-7■■□□□ 11.9
PRPF4O43172 CTBP1-212ENST00000513420 704 ntTSL 314.05□□□□□ -0.168e-7■■□□□ 11.9
PRPF4O43172 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.281e-7■■□□□ 11.9
PRPF4O43172 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.131e-7■■□□□ 11.9
PRPF4O43172 LSS-211ENST00000522411 2523 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.021e-7■■□□□ 11.9
PRPF4O43172 LSS-201ENST00000356396 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.171e-7■■□□□ 11.9
PRPF4O43172 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.513e-10■■□□□ 11.9
PRPF4O43172 FKBP10-206ENST00000489591 2826 ntTSL 217.57■□□□□ 0.43e-10■■□□□ 11.9
PRPF4O43172 FKBP10-203ENST00000455106 1965 ntTSL 215.05■□□□□ -03e-10■■□□□ 11.9
PRPF4O43172 SRCIN1-211ENST00000612431 1431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best)23.62■■□□□ 1.378e-9■■□□□ 11.9
PRPF4O43172 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.881e-10■■□□□ 11.9
PRPF4O43172 ORMDL1-206ENST00000458355 914 ntTSL 318.26■□□□□ 0.511e-10■■□□□ 11.9
PRPF4O43172 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.221e-10■■□□□ 11.9
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