Protein–RNA interactions for Protein: O14967

CLGN, Calmegin, humanhuman

Predictions only

Length 610 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLGNO14967 CLCN7-201ENST00000262318 3717 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CLGNO14967 JPH4-201ENST00000356300 4278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CLGNO14967 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CLGNO14967 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CLGNO14967 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CLGNO14967 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CLGNO14967 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CLGNO14967 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CLGNO14967 AICDA-201ENST00000229335 2819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CLGNO14967 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CLGNO14967 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CLGNO14967 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CLGNO14967 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CLGNO14967 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CLGNO14967 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CLGNO14967 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CLGNO14967 LINC00987-201ENST00000427111 2472 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CLGNO14967 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CLGNO14967 PRDM15-201ENST00000269844 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CLGNO14967 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CLGNO14967 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CLGNO14967 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CLGNO14967 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CLGNO14967 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CLGNO14967 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CLGNO14967 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CLGNO14967 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CLGNO14967 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CLGNO14967 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CLGNO14967 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CLGNO14967 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CLGNO14967 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CLGNO14967 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
CLGNO14967 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CLGNO14967 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CLGNO14967 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CLGNO14967 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CLGNO14967 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
CLGNO14967 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
CLGNO14967 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CLGNO14967 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CLGNO14967 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CLGNO14967 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CLGNO14967 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CLGNO14967 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CLGNO14967 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CLGNO14967 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CLGNO14967 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CLGNO14967 TBC1D2-201ENST00000342112 3046 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CLGNO14967 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CLGNO14967 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CLGNO14967 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CLGNO14967 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CLGNO14967 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CLGNO14967 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CLGNO14967 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CLGNO14967 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CLGNO14967 NYAP1-201ENST00000300179 3581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CLGNO14967 PTPRO-201ENST00000281171 5301 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CLGNO14967 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CLGNO14967 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CLGNO14967 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CLGNO14967 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CLGNO14967 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CLGNO14967 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CLGNO14967 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CLGNO14967 SLC27A4-201ENST00000300456 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CLGNO14967 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CLGNO14967 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CLGNO14967 LINC00639-201ENST00000553932 4496 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CLGNO14967 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CLGNO14967 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CLGNO14967 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CLGNO14967 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CLGNO14967 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CLGNO14967 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CLGNO14967 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CLGNO14967 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CLGNO14967 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CLGNO14967 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CLGNO14967 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CLGNO14967 AFF4-201ENST00000265343 9552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CLGNO14967 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CLGNO14967 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CLGNO14967 SERINC2-206ENST00000536859 2072 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CLGNO14967 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CLGNO14967 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CLGNO14967 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CLGNO14967 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CLGNO14967 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CLGNO14967 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CLGNO14967 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CLGNO14967 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CLGNO14967 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CLGNO14967 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CLGNO14967 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CLGNO14967 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CLGNO14967 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
CLGNO14967 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CLGNO14967 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.8 ms