Protein–RNA interactions for Protein: A6NFA1

TRABD2B, Metalloprotease TIKI2, humanhuman

Predictions only

Length 517 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRABD2BA6NFA1 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRABD2BA6NFA1 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRABD2BA6NFA1 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRABD2BA6NFA1 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRABD2BA6NFA1 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRABD2BA6NFA1 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRABD2BA6NFA1 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRABD2BA6NFA1 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRABD2BA6NFA1 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRABD2BA6NFA1 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRABD2BA6NFA1 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRABD2BA6NFA1 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRABD2BA6NFA1 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRABD2BA6NFA1 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRABD2BA6NFA1 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRABD2BA6NFA1 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRABD2BA6NFA1 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRABD2BA6NFA1 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRABD2BA6NFA1 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRABD2BA6NFA1 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRABD2BA6NFA1 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRABD2BA6NFA1 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRABD2BA6NFA1 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRABD2BA6NFA1 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRABD2BA6NFA1 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRABD2BA6NFA1 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRABD2BA6NFA1 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRABD2BA6NFA1 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRABD2BA6NFA1 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRABD2BA6NFA1 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRABD2BA6NFA1 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRABD2BA6NFA1 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRABD2BA6NFA1 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRABD2BA6NFA1 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRABD2BA6NFA1 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRABD2BA6NFA1 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRABD2BA6NFA1 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRABD2BA6NFA1 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRABD2BA6NFA1 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRABD2BA6NFA1 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRABD2BA6NFA1 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRABD2BA6NFA1 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
TRABD2BA6NFA1 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRABD2BA6NFA1 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRABD2BA6NFA1 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRABD2BA6NFA1 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRABD2BA6NFA1 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRABD2BA6NFA1 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRABD2BA6NFA1 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRABD2BA6NFA1 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRABD2BA6NFA1 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRABD2BA6NFA1 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRABD2BA6NFA1 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRABD2BA6NFA1 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRABD2BA6NFA1 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRABD2BA6NFA1 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRABD2BA6NFA1 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRABD2BA6NFA1 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRABD2BA6NFA1 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
TRABD2BA6NFA1 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRABD2BA6NFA1 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRABD2BA6NFA1 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRABD2BA6NFA1 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRABD2BA6NFA1 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRABD2BA6NFA1 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRABD2BA6NFA1 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRABD2BA6NFA1 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRABD2BA6NFA1 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRABD2BA6NFA1 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRABD2BA6NFA1 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
TRABD2BA6NFA1 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
TRABD2BA6NFA1 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
TRABD2BA6NFA1 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRABD2BA6NFA1 NOP2-220ENST00000545915 630 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRABD2BA6NFA1 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRABD2BA6NFA1 MIR6752-201ENST00000618442 71 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
TRABD2BA6NFA1 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRABD2BA6NFA1 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRABD2BA6NFA1 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRABD2BA6NFA1 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRABD2BA6NFA1 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRABD2BA6NFA1 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
TRABD2BA6NFA1 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRABD2BA6NFA1 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRABD2BA6NFA1 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRABD2BA6NFA1 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRABD2BA6NFA1 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRABD2BA6NFA1 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRABD2BA6NFA1 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRABD2BA6NFA1 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRABD2BA6NFA1 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRABD2BA6NFA1 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRABD2BA6NFA1 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRABD2BA6NFA1 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRABD2BA6NFA1 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRABD2BA6NFA1 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRABD2BA6NFA1 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRABD2BA6NFA1 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRABD2BA6NFA1 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRABD2BA6NFA1 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms