Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQF0

ERVW-1, Syncytin-1, humanhuman

Predictions only

Length 538 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVW-1Q9UQF0 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ERVW-1Q9UQF0 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ERVW-1Q9UQF0 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ERVW-1Q9UQF0 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ERVW-1Q9UQF0 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ERVW-1Q9UQF0 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ERVW-1Q9UQF0 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ERVW-1Q9UQF0 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ERVW-1Q9UQF0 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ERVW-1Q9UQF0 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ERVW-1Q9UQF0 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ERVW-1Q9UQF0 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
ERVW-1Q9UQF0 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ERVW-1Q9UQF0 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ERVW-1Q9UQF0 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ERVW-1Q9UQF0 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ERVW-1Q9UQF0 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ERVW-1Q9UQF0 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ERVW-1Q9UQF0 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ERVW-1Q9UQF0 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ERVW-1Q9UQF0 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ERVW-1Q9UQF0 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ERVW-1Q9UQF0 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ERVW-1Q9UQF0 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ERVW-1Q9UQF0 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ERVW-1Q9UQF0 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
ERVW-1Q9UQF0 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
ERVW-1Q9UQF0 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ERVW-1Q9UQF0 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
ERVW-1Q9UQF0 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ERVW-1Q9UQF0 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ERVW-1Q9UQF0 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ERVW-1Q9UQF0 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ERVW-1Q9UQF0 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ERVW-1Q9UQF0 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ERVW-1Q9UQF0 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ERVW-1Q9UQF0 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ERVW-1Q9UQF0 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ERVW-1Q9UQF0 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ERVW-1Q9UQF0 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ERVW-1Q9UQF0 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ERVW-1Q9UQF0 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ERVW-1Q9UQF0 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ERVW-1Q9UQF0 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ERVW-1Q9UQF0 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ERVW-1Q9UQF0 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ERVW-1Q9UQF0 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ERVW-1Q9UQF0 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ERVW-1Q9UQF0 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ERVW-1Q9UQF0 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ERVW-1Q9UQF0 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ERVW-1Q9UQF0 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ERVW-1Q9UQF0 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ERVW-1Q9UQF0 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ERVW-1Q9UQF0 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ERVW-1Q9UQF0 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ERVW-1Q9UQF0 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ERVW-1Q9UQF0 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ERVW-1Q9UQF0 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ERVW-1Q9UQF0 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ERVW-1Q9UQF0 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
ERVW-1Q9UQF0 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ERVW-1Q9UQF0 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ERVW-1Q9UQF0 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
ERVW-1Q9UQF0 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ERVW-1Q9UQF0 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ERVW-1Q9UQF0 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ERVW-1Q9UQF0 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ERVW-1Q9UQF0 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ERVW-1Q9UQF0 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ERVW-1Q9UQF0 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ERVW-1Q9UQF0 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ERVW-1Q9UQF0 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ERVW-1Q9UQF0 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ERVW-1Q9UQF0 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ERVW-1Q9UQF0 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ERVW-1Q9UQF0 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ERVW-1Q9UQF0 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ERVW-1Q9UQF0 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ERVW-1Q9UQF0 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ERVW-1Q9UQF0 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ERVW-1Q9UQF0 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ERVW-1Q9UQF0 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ERVW-1Q9UQF0 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ERVW-1Q9UQF0 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ERVW-1Q9UQF0 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ERVW-1Q9UQF0 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ERVW-1Q9UQF0 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ERVW-1Q9UQF0 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ERVW-1Q9UQF0 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ERVW-1Q9UQF0 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ERVW-1Q9UQF0 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ERVW-1Q9UQF0 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
ERVW-1Q9UQF0 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ERVW-1Q9UQF0 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ERVW-1Q9UQF0 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ERVW-1Q9UQF0 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ERVW-1Q9UQF0 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ERVW-1Q9UQF0 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
ERVW-1Q9UQF0 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms