Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPV9

TRAK1, Trafficking kinesin-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 953 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAK1Q9UPV9 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TRAK1Q9UPV9 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TRAK1Q9UPV9 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TRAK1Q9UPV9 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TRAK1Q9UPV9 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TRAK1Q9UPV9 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TRAK1Q9UPV9 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TRAK1Q9UPV9 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TRAK1Q9UPV9 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TRAK1Q9UPV9 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TRAK1Q9UPV9 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TRAK1Q9UPV9 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TRAK1Q9UPV9 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TRAK1Q9UPV9 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TRAK1Q9UPV9 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TRAK1Q9UPV9 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TRAK1Q9UPV9 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TRAK1Q9UPV9 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TRAK1Q9UPV9 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TRAK1Q9UPV9 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
TRAK1Q9UPV9 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TRAK1Q9UPV9 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
TRAK1Q9UPV9 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
TRAK1Q9UPV9 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TRAK1Q9UPV9 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TRAK1Q9UPV9 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TRAK1Q9UPV9 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TRAK1Q9UPV9 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TRAK1Q9UPV9 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
TRAK1Q9UPV9 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TRAK1Q9UPV9 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TRAK1Q9UPV9 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TRAK1Q9UPV9 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TRAK1Q9UPV9 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TRAK1Q9UPV9 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TRAK1Q9UPV9 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TRAK1Q9UPV9 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
TRAK1Q9UPV9 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
TRAK1Q9UPV9 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
TRAK1Q9UPV9 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
TRAK1Q9UPV9 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
TRAK1Q9UPV9 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
TRAK1Q9UPV9 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.38
TRAK1Q9UPV9 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
TRAK1Q9UPV9 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
TRAK1Q9UPV9 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
TRAK1Q9UPV9 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
TRAK1Q9UPV9 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
TRAK1Q9UPV9 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
TRAK1Q9UPV9 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.38
TRAK1Q9UPV9 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TRAK1Q9UPV9 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TRAK1Q9UPV9 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
TRAK1Q9UPV9 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TRAK1Q9UPV9 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TRAK1Q9UPV9 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TRAK1Q9UPV9 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TRAK1Q9UPV9 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
TRAK1Q9UPV9 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
TRAK1Q9UPV9 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TRAK1Q9UPV9 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TRAK1Q9UPV9 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TRAK1Q9UPV9 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TRAK1Q9UPV9 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TRAK1Q9UPV9 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TRAK1Q9UPV9 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TRAK1Q9UPV9 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TRAK1Q9UPV9 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TRAK1Q9UPV9 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TRAK1Q9UPV9 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TRAK1Q9UPV9 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
TRAK1Q9UPV9 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TRAK1Q9UPV9 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TRAK1Q9UPV9 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TRAK1Q9UPV9 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TRAK1Q9UPV9 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TRAK1Q9UPV9 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TRAK1Q9UPV9 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TRAK1Q9UPV9 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TRAK1Q9UPV9 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TRAK1Q9UPV9 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
TRAK1Q9UPV9 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TRAK1Q9UPV9 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TRAK1Q9UPV9 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
TRAK1Q9UPV9 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
TRAK1Q9UPV9 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
TRAK1Q9UPV9 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TRAK1Q9UPV9 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
TRAK1Q9UPV9 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TRAK1Q9UPV9 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TRAK1Q9UPV9 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
TRAK1Q9UPV9 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TRAK1Q9UPV9 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TRAK1Q9UPV9 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
TRAK1Q9UPV9 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TRAK1Q9UPV9 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TRAK1Q9UPV9 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TRAK1Q9UPV9 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TRAK1Q9UPV9 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TRAK1Q9UPV9 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms