Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMR7

CLEC4A, C-type lectin domain family 4 member A, humanhuman

Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLEC4AQ9UMR7 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLEC4AQ9UMR7 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLEC4AQ9UMR7 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLEC4AQ9UMR7 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLEC4AQ9UMR7 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLEC4AQ9UMR7 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLEC4AQ9UMR7 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLEC4AQ9UMR7 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLEC4AQ9UMR7 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLEC4AQ9UMR7 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CLEC4AQ9UMR7 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLEC4AQ9UMR7 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLEC4AQ9UMR7 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLEC4AQ9UMR7 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLEC4AQ9UMR7 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLEC4AQ9UMR7 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLEC4AQ9UMR7 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLEC4AQ9UMR7 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLEC4AQ9UMR7 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLEC4AQ9UMR7 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLEC4AQ9UMR7 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLEC4AQ9UMR7 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLEC4AQ9UMR7 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLEC4AQ9UMR7 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLEC4AQ9UMR7 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLEC4AQ9UMR7 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLEC4AQ9UMR7 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLEC4AQ9UMR7 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLEC4AQ9UMR7 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CLEC4AQ9UMR7 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLEC4AQ9UMR7 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLEC4AQ9UMR7 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLEC4AQ9UMR7 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLEC4AQ9UMR7 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CLEC4AQ9UMR7 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLEC4AQ9UMR7 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLEC4AQ9UMR7 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLEC4AQ9UMR7 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLEC4AQ9UMR7 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLEC4AQ9UMR7 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLEC4AQ9UMR7 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLEC4AQ9UMR7 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLEC4AQ9UMR7 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CLEC4AQ9UMR7 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLEC4AQ9UMR7 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLEC4AQ9UMR7 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLEC4AQ9UMR7 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLEC4AQ9UMR7 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLEC4AQ9UMR7 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CLEC4AQ9UMR7 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLEC4AQ9UMR7 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLEC4AQ9UMR7 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLEC4AQ9UMR7 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLEC4AQ9UMR7 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLEC4AQ9UMR7 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLEC4AQ9UMR7 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLEC4AQ9UMR7 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLEC4AQ9UMR7 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLEC4AQ9UMR7 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLEC4AQ9UMR7 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLEC4AQ9UMR7 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLEC4AQ9UMR7 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLEC4AQ9UMR7 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLEC4AQ9UMR7 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLEC4AQ9UMR7 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLEC4AQ9UMR7 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLEC4AQ9UMR7 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLEC4AQ9UMR7 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLEC4AQ9UMR7 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLEC4AQ9UMR7 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLEC4AQ9UMR7 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLEC4AQ9UMR7 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLEC4AQ9UMR7 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLEC4AQ9UMR7 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLEC4AQ9UMR7 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLEC4AQ9UMR7 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLEC4AQ9UMR7 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLEC4AQ9UMR7 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLEC4AQ9UMR7 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLEC4AQ9UMR7 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLEC4AQ9UMR7 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLEC4AQ9UMR7 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLEC4AQ9UMR7 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLEC4AQ9UMR7 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLEC4AQ9UMR7 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLEC4AQ9UMR7 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CLEC4AQ9UMR7 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLEC4AQ9UMR7 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLEC4AQ9UMR7 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLEC4AQ9UMR7 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLEC4AQ9UMR7 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLEC4AQ9UMR7 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLEC4AQ9UMR7 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLEC4AQ9UMR7 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLEC4AQ9UMR7 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLEC4AQ9UMR7 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLEC4AQ9UMR7 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLEC4AQ9UMR7 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLEC4AQ9UMR7 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLEC4AQ9UMR7 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.4 ms