Protein–RNA interactions for Protein: Q9P003

CNIH4, Protein cornichon homolog 4, humanhuman

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Length 139 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNIH4Q9P003 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CNIH4Q9P003 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CNIH4Q9P003 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CNIH4Q9P003 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CNIH4Q9P003 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CNIH4Q9P003 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CNIH4Q9P003 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CNIH4Q9P003 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CNIH4Q9P003 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CNIH4Q9P003 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CNIH4Q9P003 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CNIH4Q9P003 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CNIH4Q9P003 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CNIH4Q9P003 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CNIH4Q9P003 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CNIH4Q9P003 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CNIH4Q9P003 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CNIH4Q9P003 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CNIH4Q9P003 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CNIH4Q9P003 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CNIH4Q9P003 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CNIH4Q9P003 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CNIH4Q9P003 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CNIH4Q9P003 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CNIH4Q9P003 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CNIH4Q9P003 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CNIH4Q9P003 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CNIH4Q9P003 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CNIH4Q9P003 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CNIH4Q9P003 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CNIH4Q9P003 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CNIH4Q9P003 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CNIH4Q9P003 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CNIH4Q9P003 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CNIH4Q9P003 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CNIH4Q9P003 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CNIH4Q9P003 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CNIH4Q9P003 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CNIH4Q9P003 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CNIH4Q9P003 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CNIH4Q9P003 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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CNIH4Q9P003 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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CNIH4Q9P003 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CNIH4Q9P003 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CNIH4Q9P003 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CNIH4Q9P003 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CNIH4Q9P003 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CNIH4Q9P003 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CNIH4Q9P003 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CNIH4Q9P003 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
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CNIH4Q9P003 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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CNIH4Q9P003 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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CNIH4Q9P003 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CNIH4Q9P003 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CNIH4Q9P003 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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CNIH4Q9P003 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CNIH4Q9P003 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
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CNIH4Q9P003 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CNIH4Q9P003 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CNIH4Q9P003 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CNIH4Q9P003 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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CNIH4Q9P003 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CNIH4Q9P003 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CNIH4Q9P003 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CNIH4Q9P003 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CNIH4Q9P003 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CNIH4Q9P003 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CNIH4Q9P003 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CNIH4Q9P003 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CNIH4Q9P003 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CNIH4Q9P003 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CNIH4Q9P003 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CNIH4Q9P003 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CNIH4Q9P003 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CNIH4Q9P003 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CNIH4Q9P003 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CNIH4Q9P003 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CNIH4Q9P003 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CNIH4Q9P003 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CNIH4Q9P003 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CNIH4Q9P003 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CNIH4Q9P003 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CNIH4Q9P003 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CNIH4Q9P003 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CNIH4Q9P003 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CNIH4Q9P003 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CNIH4Q9P003 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
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