Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP66

HMG20A, High mobility group protein 20A, humanhuman

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMG20AQ9NP66 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HMG20AQ9NP66 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HMG20AQ9NP66 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HMG20AQ9NP66 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HMG20AQ9NP66 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HMG20AQ9NP66 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HMG20AQ9NP66 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HMG20AQ9NP66 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HMG20AQ9NP66 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HMG20AQ9NP66 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HMG20AQ9NP66 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HMG20AQ9NP66 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HMG20AQ9NP66 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HMG20AQ9NP66 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HMG20AQ9NP66 WSCD1-201ENST00000317744 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HMG20AQ9NP66 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HMG20AQ9NP66 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HMG20AQ9NP66 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HMG20AQ9NP66 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HMG20AQ9NP66 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HMG20AQ9NP66 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HMG20AQ9NP66 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HMG20AQ9NP66 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HMG20AQ9NP66 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HMG20AQ9NP66 HSPH1-201ENST00000320027 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HMG20AQ9NP66 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HMG20AQ9NP66 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HMG20AQ9NP66 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HMG20AQ9NP66 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HMG20AQ9NP66 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HMG20AQ9NP66 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HMG20AQ9NP66 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HMG20AQ9NP66 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HMG20AQ9NP66 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HMG20AQ9NP66 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HMG20AQ9NP66 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HMG20AQ9NP66 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HMG20AQ9NP66 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HMG20AQ9NP66 SYAP1-201ENST00000380155 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HMG20AQ9NP66 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HMG20AQ9NP66 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HMG20AQ9NP66 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HMG20AQ9NP66 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HMG20AQ9NP66 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HMG20AQ9NP66 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HMG20AQ9NP66 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HMG20AQ9NP66 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HMG20AQ9NP66 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HMG20AQ9NP66 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
HMG20AQ9NP66 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HMG20AQ9NP66 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HMG20AQ9NP66 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HMG20AQ9NP66 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HMG20AQ9NP66 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HMG20AQ9NP66 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HMG20AQ9NP66 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HMG20AQ9NP66 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HMG20AQ9NP66 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
HMG20AQ9NP66 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HMG20AQ9NP66 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
HMG20AQ9NP66 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HMG20AQ9NP66 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HMG20AQ9NP66 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HMG20AQ9NP66 CHL1-202ENST00000397491 5235 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HMG20AQ9NP66 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HMG20AQ9NP66 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HMG20AQ9NP66 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HMG20AQ9NP66 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HMG20AQ9NP66 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HMG20AQ9NP66 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HMG20AQ9NP66 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HMG20AQ9NP66 REEP3-201ENST00000373758 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HMG20AQ9NP66 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HMG20AQ9NP66 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HMG20AQ9NP66 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HMG20AQ9NP66 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HMG20AQ9NP66 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HMG20AQ9NP66 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HMG20AQ9NP66 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HMG20AQ9NP66 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HMG20AQ9NP66 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HMG20AQ9NP66 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
HMG20AQ9NP66 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HMG20AQ9NP66 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HMG20AQ9NP66 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HMG20AQ9NP66 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HMG20AQ9NP66 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HMG20AQ9NP66 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HMG20AQ9NP66 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HMG20AQ9NP66 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HMG20AQ9NP66 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HMG20AQ9NP66 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
HMG20AQ9NP66 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HMG20AQ9NP66 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HMG20AQ9NP66 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HMG20AQ9NP66 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HMG20AQ9NP66 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HMG20AQ9NP66 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HMG20AQ9NP66 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
HMG20AQ9NP66 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.9 ms