Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP61

ARFGAP3, ADP-ribosylation factor GTPase-activating protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 516 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARFGAP3Q9NP61 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ARFGAP3Q9NP61 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ARFGAP3Q9NP61 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
ARFGAP3Q9NP61 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ARFGAP3Q9NP61 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ARFGAP3Q9NP61 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ARFGAP3Q9NP61 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ARFGAP3Q9NP61 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ARFGAP3Q9NP61 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ARFGAP3Q9NP61 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
ARFGAP3Q9NP61 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ARFGAP3Q9NP61 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ARFGAP3Q9NP61 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ARFGAP3Q9NP61 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ARFGAP3Q9NP61 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ARFGAP3Q9NP61 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ARFGAP3Q9NP61 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ARFGAP3Q9NP61 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
ARFGAP3Q9NP61 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ARFGAP3Q9NP61 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ARFGAP3Q9NP61 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ARFGAP3Q9NP61 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ARFGAP3Q9NP61 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ARFGAP3Q9NP61 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ARFGAP3Q9NP61 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ARFGAP3Q9NP61 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
ARFGAP3Q9NP61 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ARFGAP3Q9NP61 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ARFGAP3Q9NP61 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ARFGAP3Q9NP61 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ARFGAP3Q9NP61 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ARFGAP3Q9NP61 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ARFGAP3Q9NP61 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ARFGAP3Q9NP61 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ARFGAP3Q9NP61 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ARFGAP3Q9NP61 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ARFGAP3Q9NP61 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ARFGAP3Q9NP61 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ARFGAP3Q9NP61 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ARFGAP3Q9NP61 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
ARFGAP3Q9NP61 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ARFGAP3Q9NP61 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ARFGAP3Q9NP61 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ARFGAP3Q9NP61 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ARFGAP3Q9NP61 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ARFGAP3Q9NP61 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ARFGAP3Q9NP61 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ARFGAP3Q9NP61 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ARFGAP3Q9NP61 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ARFGAP3Q9NP61 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ARFGAP3Q9NP61 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ARFGAP3Q9NP61 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ARFGAP3Q9NP61 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ARFGAP3Q9NP61 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ARFGAP3Q9NP61 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ARFGAP3Q9NP61 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ARFGAP3Q9NP61 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ARFGAP3Q9NP61 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ARFGAP3Q9NP61 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ARFGAP3Q9NP61 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ARFGAP3Q9NP61 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
ARFGAP3Q9NP61 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ARFGAP3Q9NP61 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ARFGAP3Q9NP61 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
ARFGAP3Q9NP61 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ARFGAP3Q9NP61 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
ARFGAP3Q9NP61 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ARFGAP3Q9NP61 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ARFGAP3Q9NP61 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ARFGAP3Q9NP61 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ARFGAP3Q9NP61 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ARFGAP3Q9NP61 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ARFGAP3Q9NP61 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ARFGAP3Q9NP61 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ARFGAP3Q9NP61 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ARFGAP3Q9NP61 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ARFGAP3Q9NP61 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ARFGAP3Q9NP61 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ARFGAP3Q9NP61 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ARFGAP3Q9NP61 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ARFGAP3Q9NP61 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ARFGAP3Q9NP61 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ARFGAP3Q9NP61 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ARFGAP3Q9NP61 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ARFGAP3Q9NP61 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ARFGAP3Q9NP61 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ARFGAP3Q9NP61 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ARFGAP3Q9NP61 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ARFGAP3Q9NP61 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ARFGAP3Q9NP61 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ARFGAP3Q9NP61 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ARFGAP3Q9NP61 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ARFGAP3Q9NP61 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
ARFGAP3Q9NP61 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ARFGAP3Q9NP61 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ARFGAP3Q9NP61 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ARFGAP3Q9NP61 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ARFGAP3Q9NP61 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ARFGAP3Q9NP61 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
ARFGAP3Q9NP61 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms