Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCL2

GPAM, Glycerol-3-phosphate acyltransferase 1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 828 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPAMQ9HCL2 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GPAMQ9HCL2 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
GPAMQ9HCL2 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GPAMQ9HCL2 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GPAMQ9HCL2 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GPAMQ9HCL2 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GPAMQ9HCL2 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
GPAMQ9HCL2 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GPAMQ9HCL2 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GPAMQ9HCL2 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
GPAMQ9HCL2 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
GPAMQ9HCL2 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
GPAMQ9HCL2 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
GPAMQ9HCL2 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
GPAMQ9HCL2 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
GPAMQ9HCL2 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GPAMQ9HCL2 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GPAMQ9HCL2 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GPAMQ9HCL2 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GPAMQ9HCL2 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GPAMQ9HCL2 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GPAMQ9HCL2 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
GPAMQ9HCL2 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GPAMQ9HCL2 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GPAMQ9HCL2 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
GPAMQ9HCL2 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
GPAMQ9HCL2 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GPAMQ9HCL2 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GPAMQ9HCL2 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GPAMQ9HCL2 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GPAMQ9HCL2 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
GPAMQ9HCL2 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GPAMQ9HCL2 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GPAMQ9HCL2 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GPAMQ9HCL2 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
GPAMQ9HCL2 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
GPAMQ9HCL2 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GPAMQ9HCL2 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GPAMQ9HCL2 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GPAMQ9HCL2 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GPAMQ9HCL2 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GPAMQ9HCL2 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GPAMQ9HCL2 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
GPAMQ9HCL2 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GPAMQ9HCL2 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
GPAMQ9HCL2 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GPAMQ9HCL2 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC17.09■□□□□ 0.33
GPAMQ9HCL2 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GPAMQ9HCL2 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
GPAMQ9HCL2 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
GPAMQ9HCL2 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
GPAMQ9HCL2 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
GPAMQ9HCL2 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
GPAMQ9HCL2 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
GPAMQ9HCL2 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
GPAMQ9HCL2 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
GPAMQ9HCL2 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GPAMQ9HCL2 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GPAMQ9HCL2 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
GPAMQ9HCL2 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GPAMQ9HCL2 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GPAMQ9HCL2 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GPAMQ9HCL2 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
GPAMQ9HCL2 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.33
GPAMQ9HCL2 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
GPAMQ9HCL2 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.33
GPAMQ9HCL2 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
GPAMQ9HCL2 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
GPAMQ9HCL2 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
GPAMQ9HCL2 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
GPAMQ9HCL2 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
GPAMQ9HCL2 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
GPAMQ9HCL2 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
GPAMQ9HCL2 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
GPAMQ9HCL2 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
GPAMQ9HCL2 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GPAMQ9HCL2 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GPAMQ9HCL2 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GPAMQ9HCL2 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
GPAMQ9HCL2 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GPAMQ9HCL2 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
GPAMQ9HCL2 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GPAMQ9HCL2 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
GPAMQ9HCL2 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
GPAMQ9HCL2 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
GPAMQ9HCL2 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.32
GPAMQ9HCL2 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
GPAMQ9HCL2 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
GPAMQ9HCL2 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
GPAMQ9HCL2 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
GPAMQ9HCL2 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GPAMQ9HCL2 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GPAMQ9HCL2 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GPAMQ9HCL2 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GPAMQ9HCL2 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GPAMQ9HCL2 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GPAMQ9HCL2 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GPAMQ9HCL2 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
GPAMQ9HCL2 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GPAMQ9HCL2 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms