Protein–RNA interactions for Protein: Q9HC16

APOBEC3G, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3G, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 384 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC3GQ9HC16 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
APOBEC3GQ9HC16 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
APOBEC3GQ9HC16 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
APOBEC3GQ9HC16 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
APOBEC3GQ9HC16 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
APOBEC3GQ9HC16 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
APOBEC3GQ9HC16 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
APOBEC3GQ9HC16 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
APOBEC3GQ9HC16 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
APOBEC3GQ9HC16 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
APOBEC3GQ9HC16 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
APOBEC3GQ9HC16 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
APOBEC3GQ9HC16 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
APOBEC3GQ9HC16 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
APOBEC3GQ9HC16 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
APOBEC3GQ9HC16 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
APOBEC3GQ9HC16 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
APOBEC3GQ9HC16 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
APOBEC3GQ9HC16 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
APOBEC3GQ9HC16 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
APOBEC3GQ9HC16 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
APOBEC3GQ9HC16 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
APOBEC3GQ9HC16 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
APOBEC3GQ9HC16 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
APOBEC3GQ9HC16 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
APOBEC3GQ9HC16 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
APOBEC3GQ9HC16 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
APOBEC3GQ9HC16 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
APOBEC3GQ9HC16 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
APOBEC3GQ9HC16 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
APOBEC3GQ9HC16 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
APOBEC3GQ9HC16 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
APOBEC3GQ9HC16 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
APOBEC3GQ9HC16 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
APOBEC3GQ9HC16 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
APOBEC3GQ9HC16 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
APOBEC3GQ9HC16 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
APOBEC3GQ9HC16 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
APOBEC3GQ9HC16 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
APOBEC3GQ9HC16 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
APOBEC3GQ9HC16 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
APOBEC3GQ9HC16 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
APOBEC3GQ9HC16 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
APOBEC3GQ9HC16 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
APOBEC3GQ9HC16 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
APOBEC3GQ9HC16 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
APOBEC3GQ9HC16 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
APOBEC3GQ9HC16 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
APOBEC3GQ9HC16 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
APOBEC3GQ9HC16 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
APOBEC3GQ9HC16 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
APOBEC3GQ9HC16 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
APOBEC3GQ9HC16 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
APOBEC3GQ9HC16 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
APOBEC3GQ9HC16 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
APOBEC3GQ9HC16 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
APOBEC3GQ9HC16 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
APOBEC3GQ9HC16 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
APOBEC3GQ9HC16 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
APOBEC3GQ9HC16 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
APOBEC3GQ9HC16 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
APOBEC3GQ9HC16 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
APOBEC3GQ9HC16 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
APOBEC3GQ9HC16 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
APOBEC3GQ9HC16 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
APOBEC3GQ9HC16 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
APOBEC3GQ9HC16 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
APOBEC3GQ9HC16 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC18.16■□□□□ 0.5
APOBEC3GQ9HC16 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
APOBEC3GQ9HC16 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC18.16■□□□□ 0.5
APOBEC3GQ9HC16 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
APOBEC3GQ9HC16 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
APOBEC3GQ9HC16 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
APOBEC3GQ9HC16 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
APOBEC3GQ9HC16 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
APOBEC3GQ9HC16 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
APOBEC3GQ9HC16 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
APOBEC3GQ9HC16 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
APOBEC3GQ9HC16 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
APOBEC3GQ9HC16 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
APOBEC3GQ9HC16 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
APOBEC3GQ9HC16 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
APOBEC3GQ9HC16 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
APOBEC3GQ9HC16 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
APOBEC3GQ9HC16 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
APOBEC3GQ9HC16 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
APOBEC3GQ9HC16 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
APOBEC3GQ9HC16 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
APOBEC3GQ9HC16 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
APOBEC3GQ9HC16 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
APOBEC3GQ9HC16 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
APOBEC3GQ9HC16 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
APOBEC3GQ9HC16 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
APOBEC3GQ9HC16 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
APOBEC3GQ9HC16 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
APOBEC3GQ9HC16 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
APOBEC3GQ9HC16 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
APOBEC3GQ9HC16 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
APOBEC3GQ9HC16 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
APOBEC3GQ9HC16 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms