Protein–RNA interactions for Protein: Q9HBJ7

USP29, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 29, humanhuman

Predictions only

Length 922 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP29Q9HBJ7 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
USP29Q9HBJ7 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
USP29Q9HBJ7 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
USP29Q9HBJ7 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
USP29Q9HBJ7 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
USP29Q9HBJ7 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
USP29Q9HBJ7 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
USP29Q9HBJ7 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
USP29Q9HBJ7 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
USP29Q9HBJ7 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
USP29Q9HBJ7 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
USP29Q9HBJ7 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
USP29Q9HBJ7 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
USP29Q9HBJ7 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
USP29Q9HBJ7 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
USP29Q9HBJ7 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
USP29Q9HBJ7 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
USP29Q9HBJ7 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
USP29Q9HBJ7 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
USP29Q9HBJ7 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
USP29Q9HBJ7 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
USP29Q9HBJ7 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
USP29Q9HBJ7 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
USP29Q9HBJ7 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
USP29Q9HBJ7 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
USP29Q9HBJ7 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC17.57■□□□□ 0.4
USP29Q9HBJ7 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
USP29Q9HBJ7 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
USP29Q9HBJ7 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
USP29Q9HBJ7 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
USP29Q9HBJ7 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC17.57■□□□□ 0.4
USP29Q9HBJ7 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
USP29Q9HBJ7 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
USP29Q9HBJ7 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
USP29Q9HBJ7 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
USP29Q9HBJ7 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
USP29Q9HBJ7 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
USP29Q9HBJ7 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
USP29Q9HBJ7 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
USP29Q9HBJ7 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
USP29Q9HBJ7 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
USP29Q9HBJ7 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
USP29Q9HBJ7 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
USP29Q9HBJ7 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
USP29Q9HBJ7 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
USP29Q9HBJ7 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
USP29Q9HBJ7 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
USP29Q9HBJ7 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
USP29Q9HBJ7 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
USP29Q9HBJ7 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
USP29Q9HBJ7 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
USP29Q9HBJ7 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
USP29Q9HBJ7 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
USP29Q9HBJ7 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
USP29Q9HBJ7 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
USP29Q9HBJ7 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
USP29Q9HBJ7 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
USP29Q9HBJ7 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
USP29Q9HBJ7 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
USP29Q9HBJ7 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
USP29Q9HBJ7 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
USP29Q9HBJ7 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
USP29Q9HBJ7 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
USP29Q9HBJ7 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
USP29Q9HBJ7 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
USP29Q9HBJ7 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
USP29Q9HBJ7 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
USP29Q9HBJ7 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
USP29Q9HBJ7 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
USP29Q9HBJ7 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
USP29Q9HBJ7 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
USP29Q9HBJ7 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
USP29Q9HBJ7 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
USP29Q9HBJ7 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
USP29Q9HBJ7 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
USP29Q9HBJ7 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
USP29Q9HBJ7 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
USP29Q9HBJ7 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
USP29Q9HBJ7 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
USP29Q9HBJ7 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
USP29Q9HBJ7 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
USP29Q9HBJ7 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
USP29Q9HBJ7 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
USP29Q9HBJ7 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
USP29Q9HBJ7 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
USP29Q9HBJ7 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
USP29Q9HBJ7 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
USP29Q9HBJ7 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
USP29Q9HBJ7 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
USP29Q9HBJ7 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
USP29Q9HBJ7 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
USP29Q9HBJ7 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
USP29Q9HBJ7 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
USP29Q9HBJ7 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
USP29Q9HBJ7 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
USP29Q9HBJ7 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
USP29Q9HBJ7 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
USP29Q9HBJ7 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
USP29Q9HBJ7 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC17.55■□□□□ 0.4
USP29Q9HBJ7 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms