Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYJ9

YTHDF1, YTH domain-containing family protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 559 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YTHDF1Q9BYJ9 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
YTHDF1Q9BYJ9 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
YTHDF1Q9BYJ9 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
YTHDF1Q9BYJ9 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
YTHDF1Q9BYJ9 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
YTHDF1Q9BYJ9 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
YTHDF1Q9BYJ9 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
YTHDF1Q9BYJ9 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
YTHDF1Q9BYJ9 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
YTHDF1Q9BYJ9 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
YTHDF1Q9BYJ9 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
YTHDF1Q9BYJ9 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
YTHDF1Q9BYJ9 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
YTHDF1Q9BYJ9 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
YTHDF1Q9BYJ9 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
YTHDF1Q9BYJ9 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
YTHDF1Q9BYJ9 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
YTHDF1Q9BYJ9 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
YTHDF1Q9BYJ9 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
YTHDF1Q9BYJ9 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
YTHDF1Q9BYJ9 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
YTHDF1Q9BYJ9 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
YTHDF1Q9BYJ9 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
YTHDF1Q9BYJ9 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
YTHDF1Q9BYJ9 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
YTHDF1Q9BYJ9 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
YTHDF1Q9BYJ9 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
YTHDF1Q9BYJ9 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
YTHDF1Q9BYJ9 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
YTHDF1Q9BYJ9 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
YTHDF1Q9BYJ9 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
YTHDF1Q9BYJ9 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
YTHDF1Q9BYJ9 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
YTHDF1Q9BYJ9 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
YTHDF1Q9BYJ9 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
YTHDF1Q9BYJ9 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
YTHDF1Q9BYJ9 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
YTHDF1Q9BYJ9 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
YTHDF1Q9BYJ9 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
YTHDF1Q9BYJ9 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
YTHDF1Q9BYJ9 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
YTHDF1Q9BYJ9 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
YTHDF1Q9BYJ9 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
YTHDF1Q9BYJ9 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
YTHDF1Q9BYJ9 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
YTHDF1Q9BYJ9 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
YTHDF1Q9BYJ9 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
YTHDF1Q9BYJ9 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
YTHDF1Q9BYJ9 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
YTHDF1Q9BYJ9 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
YTHDF1Q9BYJ9 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
YTHDF1Q9BYJ9 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
YTHDF1Q9BYJ9 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
YTHDF1Q9BYJ9 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
YTHDF1Q9BYJ9 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
YTHDF1Q9BYJ9 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
YTHDF1Q9BYJ9 AC020659.1-201ENST00000309874 2900 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
YTHDF1Q9BYJ9 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
YTHDF1Q9BYJ9 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
YTHDF1Q9BYJ9 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
YTHDF1Q9BYJ9 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
YTHDF1Q9BYJ9 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
YTHDF1Q9BYJ9 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
YTHDF1Q9BYJ9 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
YTHDF1Q9BYJ9 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
YTHDF1Q9BYJ9 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
YTHDF1Q9BYJ9 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
YTHDF1Q9BYJ9 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
YTHDF1Q9BYJ9 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
YTHDF1Q9BYJ9 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
YTHDF1Q9BYJ9 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
YTHDF1Q9BYJ9 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
YTHDF1Q9BYJ9 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
YTHDF1Q9BYJ9 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
YTHDF1Q9BYJ9 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
YTHDF1Q9BYJ9 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
YTHDF1Q9BYJ9 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
YTHDF1Q9BYJ9 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
YTHDF1Q9BYJ9 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
YTHDF1Q9BYJ9 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
YTHDF1Q9BYJ9 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
YTHDF1Q9BYJ9 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
YTHDF1Q9BYJ9 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
YTHDF1Q9BYJ9 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
YTHDF1Q9BYJ9 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
YTHDF1Q9BYJ9 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
YTHDF1Q9BYJ9 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
YTHDF1Q9BYJ9 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
YTHDF1Q9BYJ9 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
YTHDF1Q9BYJ9 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
YTHDF1Q9BYJ9 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
YTHDF1Q9BYJ9 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
YTHDF1Q9BYJ9 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
YTHDF1Q9BYJ9 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
YTHDF1Q9BYJ9 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
YTHDF1Q9BYJ9 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
YTHDF1Q9BYJ9 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
YTHDF1Q9BYJ9 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
YTHDF1Q9BYJ9 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
YTHDF1Q9BYJ9 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms