Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWC9

CCDC106, Coiled-coil domain-containing protein 106, humanhuman

Predictions only

Length 280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC106Q9BWC9 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC106Q9BWC9 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC106Q9BWC9 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC106Q9BWC9 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC106Q9BWC9 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC106Q9BWC9 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC106Q9BWC9 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC106Q9BWC9 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC106Q9BWC9 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC106Q9BWC9 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC106Q9BWC9 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC106Q9BWC9 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC106Q9BWC9 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC106Q9BWC9 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC106Q9BWC9 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC106Q9BWC9 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC106Q9BWC9 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC106Q9BWC9 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC106Q9BWC9 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC106Q9BWC9 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC106Q9BWC9 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC106Q9BWC9 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC106Q9BWC9 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC106Q9BWC9 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC106Q9BWC9 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC106Q9BWC9 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC106Q9BWC9 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC106Q9BWC9 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC106Q9BWC9 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC106Q9BWC9 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC106Q9BWC9 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC106Q9BWC9 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC106Q9BWC9 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC106Q9BWC9 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC106Q9BWC9 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC106Q9BWC9 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC106Q9BWC9 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC106Q9BWC9 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC106Q9BWC9 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC106Q9BWC9 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC106Q9BWC9 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC106Q9BWC9 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC106Q9BWC9 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC106Q9BWC9 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC106Q9BWC9 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC106Q9BWC9 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC106Q9BWC9 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC106Q9BWC9 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC106Q9BWC9 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC106Q9BWC9 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC106Q9BWC9 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC106Q9BWC9 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC106Q9BWC9 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC106Q9BWC9 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC106Q9BWC9 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC106Q9BWC9 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC106Q9BWC9 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC106Q9BWC9 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC106Q9BWC9 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC106Q9BWC9 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC106Q9BWC9 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC106Q9BWC9 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC106Q9BWC9 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC106Q9BWC9 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC106Q9BWC9 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC106Q9BWC9 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC106Q9BWC9 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC106Q9BWC9 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC106Q9BWC9 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC106Q9BWC9 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC106Q9BWC9 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC106Q9BWC9 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC106Q9BWC9 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC106Q9BWC9 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC106Q9BWC9 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC106Q9BWC9 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC106Q9BWC9 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC106Q9BWC9 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC106Q9BWC9 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC106Q9BWC9 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC106Q9BWC9 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC106Q9BWC9 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC106Q9BWC9 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC106Q9BWC9 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC106Q9BWC9 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC106Q9BWC9 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC106Q9BWC9 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC106Q9BWC9 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC106Q9BWC9 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC106Q9BWC9 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC106Q9BWC9 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC106Q9BWC9 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC106Q9BWC9 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC106Q9BWC9 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC106Q9BWC9 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC106Q9BWC9 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC106Q9BWC9 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC106Q9BWC9 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC106Q9BWC9 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC106Q9BWC9 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms