Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW72

HIGD2A, HIG1 domain family member 2A, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 106 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIGD2AQ9BW72 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
HIGD2AQ9BW72 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
HIGD2AQ9BW72 HIC2-202ENST00000407598 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
HIGD2AQ9BW72 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
HIGD2AQ9BW72 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
HIGD2AQ9BW72 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
HIGD2AQ9BW72 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
HIGD2AQ9BW72 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
HIGD2AQ9BW72 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
HIGD2AQ9BW72 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
HIGD2AQ9BW72 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
HIGD2AQ9BW72 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
HIGD2AQ9BW72 ZNF559-202ENST00000393883 5095 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
HIGD2AQ9BW72 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
HIGD2AQ9BW72 ARL10-201ENST00000310389 10845 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
HIGD2AQ9BW72 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
HIGD2AQ9BW72 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
HIGD2AQ9BW72 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
HIGD2AQ9BW72 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
HIGD2AQ9BW72 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
HIGD2AQ9BW72 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
HIGD2AQ9BW72 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
HIGD2AQ9BW72 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
HIGD2AQ9BW72 KDM5B-202ENST00000367264 6449 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
HIGD2AQ9BW72 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
HIGD2AQ9BW72 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
HIGD2AQ9BW72 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
HIGD2AQ9BW72 NDC1-201ENST00000371429 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
HIGD2AQ9BW72 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
HIGD2AQ9BW72 TBC1D1-201ENST00000261439 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
HIGD2AQ9BW72 ZFR2-201ENST00000262961 4756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
HIGD2AQ9BW72 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
HIGD2AQ9BW72 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
HIGD2AQ9BW72 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
HIGD2AQ9BW72 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
HIGD2AQ9BW72 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
HIGD2AQ9BW72 PCDHA3-202ENST00000532566 4594 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
HIGD2AQ9BW72 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC10.88□□□□□ -0.67
HIGD2AQ9BW72 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
HIGD2AQ9BW72 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
HIGD2AQ9BW72 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
HIGD2AQ9BW72 PCM1-201ENST00000325083 6820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
HIGD2AQ9BW72 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
HIGD2AQ9BW72 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
HIGD2AQ9BW72 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
HIGD2AQ9BW72 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
HIGD2AQ9BW72 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
HIGD2AQ9BW72 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
HIGD2AQ9BW72 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
HIGD2AQ9BW72 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
HIGD2AQ9BW72 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
HIGD2AQ9BW72 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
HIGD2AQ9BW72 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC10.88□□□□□ -0.67
HIGD2AQ9BW72 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
HIGD2AQ9BW72 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC10.88□□□□□ -0.67
HIGD2AQ9BW72 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
HIGD2AQ9BW72 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
HIGD2AQ9BW72 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC10.88□□□□□ -0.67
HIGD2AQ9BW72 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC10.88□□□□□ -0.67
HIGD2AQ9BW72 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
HIGD2AQ9BW72 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
HIGD2AQ9BW72 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
HIGD2AQ9BW72 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC10.88□□□□□ -0.67
HIGD2AQ9BW72 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
HIGD2AQ9BW72 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC10.88□□□□□ -0.67
HIGD2AQ9BW72 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC10.88□□□□□ -0.67
HIGD2AQ9BW72 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC10.88□□□□□ -0.67
HIGD2AQ9BW72 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
HIGD2AQ9BW72 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
HIGD2AQ9BW72 ACTN2-206ENST00000542672 4906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
HIGD2AQ9BW72 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
HIGD2AQ9BW72 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
HIGD2AQ9BW72 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
HIGD2AQ9BW72 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
HIGD2AQ9BW72 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
HIGD2AQ9BW72 PLLP-205ENST00000613167 7578 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
HIGD2AQ9BW72 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
HIGD2AQ9BW72 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
HIGD2AQ9BW72 RNF8-202ENST00000373479 5631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
HIGD2AQ9BW72 SUCO-210ENST00000616058 5495 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
HIGD2AQ9BW72 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
HIGD2AQ9BW72 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
HIGD2AQ9BW72 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
HIGD2AQ9BW72 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
HIGD2AQ9BW72 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
HIGD2AQ9BW72 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
HIGD2AQ9BW72 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
HIGD2AQ9BW72 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
HIGD2AQ9BW72 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
HIGD2AQ9BW72 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
HIGD2AQ9BW72 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
HIGD2AQ9BW72 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
HIGD2AQ9BW72 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
HIGD2AQ9BW72 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
HIGD2AQ9BW72 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
HIGD2AQ9BW72 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
HIGD2AQ9BW72 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
HIGD2AQ9BW72 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
HIGD2AQ9BW72 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
HIGD2AQ9BW72 GPRASP1-205ENST00000537097 5980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms