Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSH3

NICN1, Nicolin-1, humanhuman

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Length 213 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NICN1Q9BSH3 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
NICN1Q9BSH3 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
NICN1Q9BSH3 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
NICN1Q9BSH3 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
NICN1Q9BSH3 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
NICN1Q9BSH3 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
NICN1Q9BSH3 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
NICN1Q9BSH3 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
NICN1Q9BSH3 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
NICN1Q9BSH3 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
NICN1Q9BSH3 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
NICN1Q9BSH3 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
NICN1Q9BSH3 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
NICN1Q9BSH3 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
NICN1Q9BSH3 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
NICN1Q9BSH3 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
NICN1Q9BSH3 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
NICN1Q9BSH3 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
NICN1Q9BSH3 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
NICN1Q9BSH3 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
NICN1Q9BSH3 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
NICN1Q9BSH3 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
NICN1Q9BSH3 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
NICN1Q9BSH3 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
NICN1Q9BSH3 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
NICN1Q9BSH3 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
NICN1Q9BSH3 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
NICN1Q9BSH3 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
NICN1Q9BSH3 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
NICN1Q9BSH3 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
NICN1Q9BSH3 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
NICN1Q9BSH3 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
NICN1Q9BSH3 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
NICN1Q9BSH3 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
NICN1Q9BSH3 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
NICN1Q9BSH3 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
NICN1Q9BSH3 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
NICN1Q9BSH3 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
NICN1Q9BSH3 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
NICN1Q9BSH3 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
NICN1Q9BSH3 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
NICN1Q9BSH3 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
NICN1Q9BSH3 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
NICN1Q9BSH3 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
NICN1Q9BSH3 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
NICN1Q9BSH3 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
NICN1Q9BSH3 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
NICN1Q9BSH3 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
NICN1Q9BSH3 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
NICN1Q9BSH3 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
NICN1Q9BSH3 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
NICN1Q9BSH3 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
NICN1Q9BSH3 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
NICN1Q9BSH3 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
NICN1Q9BSH3 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
NICN1Q9BSH3 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
NICN1Q9BSH3 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
NICN1Q9BSH3 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
NICN1Q9BSH3 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
NICN1Q9BSH3 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
NICN1Q9BSH3 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
NICN1Q9BSH3 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
NICN1Q9BSH3 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
NICN1Q9BSH3 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
NICN1Q9BSH3 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
NICN1Q9BSH3 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
NICN1Q9BSH3 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
NICN1Q9BSH3 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
NICN1Q9BSH3 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
NICN1Q9BSH3 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
NICN1Q9BSH3 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
NICN1Q9BSH3 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
NICN1Q9BSH3 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
NICN1Q9BSH3 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
NICN1Q9BSH3 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
NICN1Q9BSH3 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
NICN1Q9BSH3 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
NICN1Q9BSH3 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
NICN1Q9BSH3 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
NICN1Q9BSH3 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
NICN1Q9BSH3 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
NICN1Q9BSH3 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
NICN1Q9BSH3 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
NICN1Q9BSH3 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
NICN1Q9BSH3 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
NICN1Q9BSH3 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC14.66□□□□□ -0.06
NICN1Q9BSH3 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
NICN1Q9BSH3 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
NICN1Q9BSH3 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
NICN1Q9BSH3 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
NICN1Q9BSH3 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
NICN1Q9BSH3 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
NICN1Q9BSH3 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
NICN1Q9BSH3 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
NICN1Q9BSH3 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
NICN1Q9BSH3 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
NICN1Q9BSH3 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
NICN1Q9BSH3 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
NICN1Q9BSH3 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
NICN1Q9BSH3 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
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