Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQW3

EBF4, Transcription factor COE4, humanhuman

Predictions only

Length 602 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EBF4Q9BQW3 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
EBF4Q9BQW3 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
EBF4Q9BQW3 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
EBF4Q9BQW3 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
EBF4Q9BQW3 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
EBF4Q9BQW3 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
EBF4Q9BQW3 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
EBF4Q9BQW3 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
EBF4Q9BQW3 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
EBF4Q9BQW3 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
EBF4Q9BQW3 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
EBF4Q9BQW3 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.26
EBF4Q9BQW3 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
EBF4Q9BQW3 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
EBF4Q9BQW3 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.26
EBF4Q9BQW3 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.26
EBF4Q9BQW3 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.26
EBF4Q9BQW3 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
EBF4Q9BQW3 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
EBF4Q9BQW3 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
EBF4Q9BQW3 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
EBF4Q9BQW3 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
EBF4Q9BQW3 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
EBF4Q9BQW3 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
EBF4Q9BQW3 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
EBF4Q9BQW3 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
EBF4Q9BQW3 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
EBF4Q9BQW3 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
EBF4Q9BQW3 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
EBF4Q9BQW3 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
EBF4Q9BQW3 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
EBF4Q9BQW3 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
EBF4Q9BQW3 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
EBF4Q9BQW3 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
EBF4Q9BQW3 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
EBF4Q9BQW3 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
EBF4Q9BQW3 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
EBF4Q9BQW3 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
EBF4Q9BQW3 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
EBF4Q9BQW3 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
EBF4Q9BQW3 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
EBF4Q9BQW3 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
EBF4Q9BQW3 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
EBF4Q9BQW3 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
EBF4Q9BQW3 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
EBF4Q9BQW3 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
EBF4Q9BQW3 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
EBF4Q9BQW3 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
EBF4Q9BQW3 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
EBF4Q9BQW3 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
EBF4Q9BQW3 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
EBF4Q9BQW3 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
EBF4Q9BQW3 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
EBF4Q9BQW3 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
EBF4Q9BQW3 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
EBF4Q9BQW3 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
EBF4Q9BQW3 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
EBF4Q9BQW3 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
EBF4Q9BQW3 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
EBF4Q9BQW3 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
EBF4Q9BQW3 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
EBF4Q9BQW3 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
EBF4Q9BQW3 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
EBF4Q9BQW3 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
EBF4Q9BQW3 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
EBF4Q9BQW3 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
EBF4Q9BQW3 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
EBF4Q9BQW3 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
EBF4Q9BQW3 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
EBF4Q9BQW3 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
EBF4Q9BQW3 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
EBF4Q9BQW3 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
EBF4Q9BQW3 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
EBF4Q9BQW3 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
EBF4Q9BQW3 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
EBF4Q9BQW3 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
EBF4Q9BQW3 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
EBF4Q9BQW3 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
EBF4Q9BQW3 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
EBF4Q9BQW3 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
EBF4Q9BQW3 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
EBF4Q9BQW3 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
EBF4Q9BQW3 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
EBF4Q9BQW3 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
EBF4Q9BQW3 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
EBF4Q9BQW3 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
EBF4Q9BQW3 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
EBF4Q9BQW3 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
EBF4Q9BQW3 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
EBF4Q9BQW3 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
EBF4Q9BQW3 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
EBF4Q9BQW3 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
EBF4Q9BQW3 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
EBF4Q9BQW3 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
EBF4Q9BQW3 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
EBF4Q9BQW3 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
EBF4Q9BQW3 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
EBF4Q9BQW3 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
EBF4Q9BQW3 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
EBF4Q9BQW3 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 108.2 ms