Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDU6

GPBAR1, G-protein coupled bile acid receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPBAR1Q8TDU6 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GPBAR1Q8TDU6 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GPBAR1Q8TDU6 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GPBAR1Q8TDU6 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GPBAR1Q8TDU6 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GPBAR1Q8TDU6 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GPBAR1Q8TDU6 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GPBAR1Q8TDU6 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GPBAR1Q8TDU6 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GPBAR1Q8TDU6 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GPBAR1Q8TDU6 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GPBAR1Q8TDU6 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GPBAR1Q8TDU6 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GPBAR1Q8TDU6 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GPBAR1Q8TDU6 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
GPBAR1Q8TDU6 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GPBAR1Q8TDU6 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GPBAR1Q8TDU6 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GPBAR1Q8TDU6 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GPBAR1Q8TDU6 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GPBAR1Q8TDU6 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GPBAR1Q8TDU6 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GPBAR1Q8TDU6 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GPBAR1Q8TDU6 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GPBAR1Q8TDU6 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GPBAR1Q8TDU6 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GPBAR1Q8TDU6 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GPBAR1Q8TDU6 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GPBAR1Q8TDU6 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GPBAR1Q8TDU6 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GPBAR1Q8TDU6 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
GPBAR1Q8TDU6 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GPBAR1Q8TDU6 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GPBAR1Q8TDU6 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GPBAR1Q8TDU6 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GPBAR1Q8TDU6 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GPBAR1Q8TDU6 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GPBAR1Q8TDU6 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GPBAR1Q8TDU6 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GPBAR1Q8TDU6 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
GPBAR1Q8TDU6 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GPBAR1Q8TDU6 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GPBAR1Q8TDU6 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GPBAR1Q8TDU6 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GPBAR1Q8TDU6 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GPBAR1Q8TDU6 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GPBAR1Q8TDU6 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GPBAR1Q8TDU6 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GPBAR1Q8TDU6 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GPBAR1Q8TDU6 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GPBAR1Q8TDU6 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GPBAR1Q8TDU6 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GPBAR1Q8TDU6 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GPBAR1Q8TDU6 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GPBAR1Q8TDU6 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GPBAR1Q8TDU6 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
GPBAR1Q8TDU6 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GPBAR1Q8TDU6 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
GPBAR1Q8TDU6 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GPBAR1Q8TDU6 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
GPBAR1Q8TDU6 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GPBAR1Q8TDU6 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
GPBAR1Q8TDU6 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GPBAR1Q8TDU6 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GPBAR1Q8TDU6 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GPBAR1Q8TDU6 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GPBAR1Q8TDU6 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GPBAR1Q8TDU6 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GPBAR1Q8TDU6 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GPBAR1Q8TDU6 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GPBAR1Q8TDU6 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GPBAR1Q8TDU6 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GPBAR1Q8TDU6 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GPBAR1Q8TDU6 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GPBAR1Q8TDU6 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GPBAR1Q8TDU6 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GPBAR1Q8TDU6 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GPBAR1Q8TDU6 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GPBAR1Q8TDU6 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GPBAR1Q8TDU6 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GPBAR1Q8TDU6 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GPBAR1Q8TDU6 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GPBAR1Q8TDU6 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GPBAR1Q8TDU6 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GPBAR1Q8TDU6 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GPBAR1Q8TDU6 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GPBAR1Q8TDU6 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GPBAR1Q8TDU6 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GPBAR1Q8TDU6 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GPBAR1Q8TDU6 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GPBAR1Q8TDU6 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GPBAR1Q8TDU6 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
GPBAR1Q8TDU6 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GPBAR1Q8TDU6 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GPBAR1Q8TDU6 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
GPBAR1Q8TDU6 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GPBAR1Q8TDU6 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GPBAR1Q8TDU6 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GPBAR1Q8TDU6 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GPBAR1Q8TDU6 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.2 ms